RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376303.6

SYP-202, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-202ENST00000376303 EFCAB14O75071 495 aa20.27■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 RXRAP19793 462 aa20.27■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 WDR5P61964 334 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 SEMA3FQ13275 785 aa20.27■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 HIC1Q14526 733 aa20.27■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 ZNF618Q5T7W0 954 aa20.27■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 NLRX1Q86UT6 975 aa20.27■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 SERINC5Q86VE9 423 aa20.27■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 SGMS1Q86VZ5 419 aa20.27■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 FANCBQ8NB91 859 aa20.27■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 WNT8BQ93098 351 aa20.27■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.27■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 PRDM6Q9NQX0 595 aa20.27■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 TLL1O43897 1013 aa20.26■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 HOXC8P31273 242 aa20.26■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 TRAF7Q6Q0C0 670 aa20.26■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 ATP6V0A1Q93050 837 aa20.26■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 GPR20Q99678 358 aa20.26■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 LRRC2Q9BYS8 371 aa20.26■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 THEGQ9P2T0 379 aa20.26■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 EMSYQ7Z589 1322 aa20.26■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 MICAL3Q7RTP6 2002 aa20.26■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 MUC3AQ02505 3323 aa20.25■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa20.25■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.25■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 TAP1Q03518 808 aa20.25■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 IKBKEQ14164 716 aa20.25■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.25■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 TMTC3Q6ZXV5 915 aa20.25■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 RNPEPQ9H4A4 650 aa20.25■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 NCOR1O75376 2440 aa20.25■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 REV3LO60673 3130 aa20.24■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 GNAT1P11488 350 aa20.24■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 THPOP40225 353 aa20.24■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 MBTPS1Q14703 1052 aa20.24■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 MICU3Q86XE3 530 aa20.24■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 CCDC82Q8N4S0 544 aa20.24■□□□□ 0.83
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SYP-202ENST00000376303 CDHR1Q96JP9 859 aa20.24■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 NEK1Q96PY6 1258 aa20.24■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 ZBED2Q9BTP6 218 aa20.24■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 CERS4Q9HA82 394 aa20.24■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 RSPH10B2B2RC85 870 aa20.23■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 TREHO43280 583 aa20.23■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 LGR5O75473 907 aa20.23■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 RSPH10BP0C881 870 aa20.23■□□□□ 0.83
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SYP-202ENST00000376303 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.23■□□□□ 0.83
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SYP-202ENST00000376303 GJB5O95377 273 aa20.22■□□□□ 0.83
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SYP-202ENST00000376303 TCTN1Q2MV58 587 aa20.22■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 TSGA10IPQ3SY00 556 aa20.22■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 APOA5Q6Q788 366 aa20.22■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 ARNTL2Q8WYA1 636 aa20.22■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 ASB2Q96Q27 587 aa20.22■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 MTCH2Q9Y6C9 303 aa20.22■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 MAFGO15525 162 aa20.21■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 ARHGEF15O94989 841 aa20.21■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 SP4Q02446 784 aa20.21■□□□□ 0.83
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SYP-202ENST00000376303 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa20.21■□□□□ 0.83
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SYP-202ENST00000376303 SKAP1Q86WV1 359 aa20.21■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 TRIM50Q86XT4 487 aa20.21■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 MICALL1Q8N3F8 863 aa20.21■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 RAD9AQ99638 391 aa20.21■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 SETD4Q9NVD3 440 aa20.21■□□□□ 0.83
SYP-202ENST00000376303 PCDHA6Q9UN73 950 aa20.21■□□□□ 0.83
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SYP-202ENST00000376303 XIRP2A4UGR9 3374 aa20.2■□□□□ 0.82
SYP-202ENST00000376303 EPOPA6NHQ4 379 aa20.2■□□□□ 0.82
SYP-202ENST00000376303 KCNA2P16389 499 aa20.2■□□□□ 0.82
SYP-202ENST00000376303 ITGB5P18084 799 aa20.2■□□□□ 0.82
SYP-202ENST00000376303 KRT32Q14532 448 aa20.2■□□□□ 0.82
SYP-202ENST00000376303 UBE2SQ16763 222 aa20.2■□□□□ 0.82
SYP-202ENST00000376303 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.2■□□□□ 0.82
SYP-202ENST00000376303 TEX2Q8IWB9 1127 aa20.2■□□□□ 0.82
SYP-202ENST00000376303 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.2■□□□□ 0.82
SYP-202ENST00000376303 EHMT1Q9H9B1 1298 aa20.2■□□□□ 0.82
SYP-202ENST00000376303 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa20.2■□□□□ 0.82
SYP-202ENST00000376303 NRCAMQ92823 1304 aa20.2■□□□□ 0.82
SYP-202ENST00000376303 SIP14410 1827 aa20.19■□□□□ 0.82
SYP-202ENST00000376303 LCHNA4D1U4 455 aa20.19■□□□□ 0.82
SYP-202ENST00000376303 ATP9AO75110 1047 aa20.19■□□□□ 0.82
SYP-202ENST00000376303 CDC45O75419 566 aa20.19■□□□□ 0.82
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