RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa24.36■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 LGR5O75473 907 aa24.36■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 KIF5BP33176 963 aa24.36■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 THPOP40225 353 aa24.36■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 CREB3L3Q68CJ9 461 aa24.36■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 TMTC2Q8N394 836 aa24.36■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 HLA-CQ95604 372 aa24.36■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.36■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 C17orf102A2RUQ5 167 aa24.35■■□□□ 1.49
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SOCS1-201ENST00000332029 BMP2KLQ5H9B9 411 aa24.35■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 FAM117BQ6P1L5 589 aa24.35■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.35■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 SKAP1Q86WV1 359 aa24.35■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 TMEM87BQ96K49 555 aa24.35■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 SPZ1Q9BXG8 430 aa24.35■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 MTUS1Q9ULD2 1270 aa24.35■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 FRMPD4Q14CM0 1322 aa24.35■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 LINC01553A4QN01 128 aa24.34■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 RSPH10B2B2RC85 870 aa24.34■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 H3BRB1 525 aa24.34■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 LGALS2P05162 132 aa24.34■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 RSPH10BP0C881 870 aa24.34■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 SMARCA1P28370 1054 aa24.34■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 ERVK-21P61565 698 aa24.34■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 GNPTABQ3T906 1256 aa24.34■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 ATP6V0A1Q93050 837 aa24.34■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 LZTS2Q9BRK4 669 aa24.34■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 BCAS3Q9H6U6 928 aa24.34■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 LMCD1Q9NZU5 365 aa24.34■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 CCDC69A6NI79 296 aa24.33■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 NOP56O00567 594 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 STAM2O75886 525 aa24.33■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa24.33■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa24.33■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 HOXC8P31273 242 aa24.33■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 ICAM3P32942 547 aa24.33■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 GNAQP50148 359 aa24.33■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 DBF4BQ8NFT6 615 aa24.33■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 SUGCTQ9HAC7 445 aa24.33■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 MYH7BA7E2Y1 1941 aa24.33■■□□□ 1.49
SOCS1-201ENST00000332029 AMHP03971 560 aa24.32■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 LIFRP42702 1097 aa24.32■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa24.31■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 TREHO43280 583 aa24.31■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 SEMA3FQ13275 785 aa24.31■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
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SOCS1-201ENST00000332029 METTL7BQ6UX53 244 aa24.31■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 CYFIP1Q7L576 1253 aa24.31■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 USP26Q9BXU7 913 aa24.31■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 RTEL1Q9NZ71 1219 aa24.31■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 INSL6Q9Y581 213 aa24.31■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 FIBPO43427 364 aa24.3■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 PLEKHA8P1O95397 391 aa24.3■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 CALM1P0DP23 149 aa24.3■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 CALM2P0DP24 149 aa24.3■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 CALM3P0DP25 149 aa24.3■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 RXRAP19793 462 aa24.3■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa24.3■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 MYOCDQ8IZQ8 938 aa24.3■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 GPR20Q99678 358 aa24.3■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 LRRC2Q9BYS8 371 aa24.3■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 RNPEPQ9H4A4 650 aa24.3■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 CAND2O75155 1236 aa24.29■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 RNF20Q5VTR2 975 aa24.29■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa24.29■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 CUL5Q93034 780 aa24.29■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa24.29■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.29■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 CTSHP09668 335 aa24.28■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 GNAT1P11488 350 aa24.28■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 USP17L6PQ6QN14 398 aa24.28■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 SEPT8Q92599 483 aa24.28■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa24.28■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 SETD4Q9NVD3 440 aa24.28■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 PIK3CDO00329 1044 aa24.27■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 PCNX4Q63HM2 1172 aa24.27■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 XRRA1Q6P2D8 792 aa24.27■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 TRIM50Q86XT4 487 aa24.27■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa24.27■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 FBXO22Q8NEZ5 403 aa24.27■■□□□ 1.48
SOCS1-201ENST00000332029 C17orf80Q9BSJ5 609 aa24.27■■□□□ 1.48
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