RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329151.5

TMEM54-201, Transcript of transmembrane protein 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM54, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54-201ENST00000329151 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
TMEM54-201ENST00000329151 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP26.87■■□□□ 1.89
TMEM54-201ENST00000329151 C16orf70Q9BSU1 422 aa26.87■■□□□ 1.89
TMEM54-201ENST00000329151 SPZ1Q9BXG8 430 aa26.87■■□□□ 1.89
TMEM54-201ENST00000329151 MTUS1Q9ULD2 1270 aa26.87■■□□□ 1.89
TMEM54-201ENST00000329151 EPOPA6NHQ4 379 aa26.86■■□□□ 1.89
TMEM54-201ENST00000329151 PRC1O43663 620 aa26.86■■□□□ 1.89
TMEM54-201ENST00000329151 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa26.86■■□□□ 1.89
TMEM54-201ENST00000329151 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa26.86■■□□□ 1.89
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TMEM54-201ENST00000329151 GRB10Q13322 594 aa26.86■■□□□ 1.89
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TMEM54-201ENST00000329151 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa26.86■■□□□ 1.89
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TMEM54-201ENST00000329151 LCHNA4D1U4 455 aa26.85■■□□□ 1.89
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TMEM54-201ENST00000329151 ANTXR2P58335 489 aa26.85■■□□□ 1.89
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TMEM54-201ENST00000329151 TFF2Q03403 129 aa26.85■■□□□ 1.89
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TMEM54-201ENST00000329151 MYL10Q9BUA6 226 aa26.85■■□□□ 1.89
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TMEM54-201ENST00000329151 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa26.84■■□□□ 1.89
TMEM54-201ENST00000329151 ARHGEF15O94989 841 aa26.84■■□□□ 1.89
TMEM54-201ENST00000329151 CALM1P0DP23 149 aa26.84■■□□□ 1.89
TMEM54-201ENST00000329151 CALM2P0DP24 149 aa26.84■■□□□ 1.89
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TMEM54-201ENST00000329151 SMARCA1P28370 1054 aa26.84■■□□□ 1.89
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TMEM54-201ENST00000329151 SEPT8Q92599 483 aa26.84■■□□□ 1.89
TMEM54-201ENST00000329151 WNT8BQ93098 351 aa26.84■■□□□ 1.89
TMEM54-201ENST00000329151 HLA-CQ95604 372 aa26.84■■□□□ 1.89
TMEM54-201ENST00000329151 TMEM87BQ96K49 555 aa26.84■■□□□ 1.89
TMEM54-201ENST00000329151 FRMPD4Q14CM0 1322 aa26.84■■□□□ 1.89
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TMEM54-201ENST00000329151 USP17L6PQ6QN14 398 aa26.83■■□□□ 1.89
TMEM54-201ENST00000329151 DBF4BQ8NFT6 615 aa26.83■■□□□ 1.89
TMEM54-201ENST00000329151 GDPD5Q8WTR4 605 aa26.83■■□□□ 1.89
TMEM54-201ENST00000329151 CDHR1Q96JP9 859 aa26.83■■□□□ 1.89
TMEM54-201ENST00000329151 INSL6Q9Y581 213 aa26.83■■□□□ 1.89
TMEM54-201ENST00000329151 SIP14410 1827 aa26.82■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 TREHO43280 583 aa26.82■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 CAND2O75155 1236 aa26.82■■□□□ 1.88
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TMEM54-201ENST00000329151 GPR20Q99678 358 aa26.82■■□□□ 1.88
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TMEM54-201ENST00000329151 EHMT1Q9H9B1 1298 aa26.81■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 SETD4Q9NVD3 440 aa26.81■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 SLC12A7Q9Y666 1083 aa26.81■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 LINC01553A4QN01 128 aa26.8■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 SPDYE3A6NKU9 549 aa26.8■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 PIK3CDO00329 1044 aa26.8■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 KCNQ1P51787 676 aa26.8■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 ARHGAP4P98171 946 aa26.8■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 HIC1Q14526 733 aa26.8■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 TRAF7Q6Q0C0 670 aa26.8■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 REV3LO60673 3130 aa26.79■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 BMP1P13497 986 aa26.79■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 ERVK-21P61565 698 aa26.79■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 TCTN1Q2MV58 587 aa26.79■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 YME1L1Q96TA2 773 aa26.79■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 BCAS3Q9H6U6 928 aa26.79■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 ANO2Q9NQ90 1003 aa26.79■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 BRWD1Q9NSI6 2320 aa26.79■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 MUC3AQ02505 3323 aa26.78■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 PLEKHA8P1O95397 391 aa26.78■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 RXRAP19793 462 aa26.78■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa26.78■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.88
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TMEM54-201ENST00000329151 TRIM50Q86XT4 487 aa26.78■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 FBXO22Q8NEZ5 403 aa26.78■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 SEMA3FQ13275 785 aa26.77■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 RNF20Q5VTR2 975 aa26.77■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 RSPH3Q86UC2 560 aa26.77■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 APBB2Q92870 758 aa26.77■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 GPRASP2Q96D09 838 aa26.77■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 SUGCTQ9HAC7 445 aa26.77■■□□□ 1.88
TMEM54-201ENST00000329151 NRCAMQ92823 1304 aa26.76■■□□□ 1.87
TMEM54-201ENST00000329151 MEIS2O14770 477 aa26.76■■□□□ 1.87
TMEM54-201ENST00000329151 SLC27A2O14975 620 aa26.76■■□□□ 1.87
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