RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 RSPH10B2B2RC85 870 aa28.92■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 RSPH10BP0C881 870 aa28.92■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa28.92■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa28.92■■■□□ 2.22
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PPP4R4-202ENST00000328839 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa28.92■■■□□ 2.22
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PPP4R4-202ENST00000328839 BMP1P13497 986 aa28.91■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 NEDD9Q14511 834 aa28.91■■■□□ 2.22
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PPP4R4-202ENST00000328839 MAP4K1Q92918 833 aa28.91■■■□□ 2.22
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PPP4R4-202ENST00000328839 LY9Q9HBG7 655 aa28.9■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 COG5Q9UP83 839 aa28.9■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 FIBPO43427 364 aa28.89■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 ICAM3P32942 547 aa28.89■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 SP4Q02446 784 aa28.89■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 USP17L6PQ6QN14 398 aa28.89■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 METTL7BQ6UX53 244 aa28.89■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP28.89■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 NFXL1Q6ZNB6 911 aa28.89■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 DBF4BQ8NFT6 615 aa28.89■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 SPZ1Q9BXG8 430 aa28.89■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 USP26Q9BXU7 913 aa28.89■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 NCOR1O75376 2440 aa28.89■■■□□ 2.21
PPP4R4-202ENST00000328839 LINC01553A4QN01 128 aa28.88■■■□□ 2.21
PPP4R4-202ENST00000328839 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa28.88■■■□□ 2.21
PPP4R4-202ENST00000328839 TREHO43280 583 aa28.88■■■□□ 2.21
PPP4R4-202ENST00000328839 DDAH1O94760 285 aa28.88■■■□□ 2.21
PPP4R4-202ENST00000328839 AMHP03971 560 aa28.88■■■□□ 2.21
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PPP4R4-202ENST00000328839 SEMA3FQ13275 785 aa28.88■■■□□ 2.21
PPP4R4-202ENST00000328839 MYOCDQ8IZQ8 938 aa28.88■■■□□ 2.21
PPP4R4-202ENST00000328839 HLA-CQ95604 372 aa28.88■■■□□ 2.21
PPP4R4-202ENST00000328839 RNPEPQ9H4A4 650 aa28.88■■■□□ 2.21
PPP4R4-202ENST00000328839 PRC1O43663 620 aa28.87■■■□□ 2.21
PPP4R4-202ENST00000328839 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
PPP4R4-202ENST00000328839 TRIM50Q86XT4 487 aa28.87■■■□□ 2.21
PPP4R4-202ENST00000328839 MAP3K14Q99558 947 aa28.87■■■□□ 2.21
PPP4R4-202ENST00000328839 GPR20Q99678 358 aa28.87■■■□□ 2.21
PPP4R4-202ENST00000328839 COL9A1P20849 921 aa28.86■■■□□ 2.21
PPP4R4-202ENST00000328839 ERVK-21P61565 698 aa28.86■■■□□ 2.21
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PPP4R4-202ENST00000328839 SETD4Q9NVD3 440 aa28.86■■■□□ 2.21
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
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PPP4R4-202ENST00000328839 HOXC8P31273 242 aa28.85■■■□□ 2.21
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PPP4R4-202ENST00000328839 INSL6Q9Y581 213 aa28.85■■■□□ 2.21
PPP4R4-202ENST00000328839 RXRAP19793 462 aa28.84■■■□□ 2.21
PPP4R4-202ENST00000328839 MCM5P33992 734 aa28.84■■■□□ 2.21
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PPP4R4-202ENST00000328839 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
PPP4R4-202ENST00000328839 SEPT8Q92599 483 aa28.84■■■□□ 2.21
PPP4R4-202ENST00000328839 LZTS2Q9BRK4 669 aa28.84■■■□□ 2.21
PPP4R4-202ENST00000328839 LMCD1Q9NZU5 365 aa28.84■■■□□ 2.21
PPP4R4-202ENST00000328839 TELO2Q9Y4R8 837 aa28.84■■■□□ 2.21
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PPP4R4-202ENST00000328839 SMARCA1P28370 1054 aa28.82■■■□□ 2.2
PPP4R4-202ENST00000328839 XRRA1Q6P2D8 792 aa28.82■■■□□ 2.2
PPP4R4-202ENST00000328839 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa28.82■■■□□ 2.2
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PPP4R4-202ENST00000328839 C17orf80Q9BSJ5 609 aa28.82■■■□□ 2.2
PPP4R4-202ENST00000328839 NLRC5Q86WI3 1866 aa28.81■■■□□ 2.2
PPP4R4-202ENST00000328839 TMTC2Q8N394 836 aa28.81■■■□□ 2.2
PPP4R4-202ENST00000328839 TMEM87BQ96K49 555 aa28.81■■■□□ 2.2
PPP4R4-202ENST00000328839 SENP7Q9BQF6 1050 aa28.81■■■□□ 2.2
PPP4R4-202ENST00000328839 MTA3Q9BTC8 594 aa28.81■■■□□ 2.2
PPP4R4-202ENST00000328839 UPP2O95045 317 aa28.8■■■□□ 2.2
PPP4R4-202ENST00000328839 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
PPP4R4-202ENST00000328839 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
PPP4R4-202ENST00000328839 LMBR1Q8WVP7 490 aa28.8■■■□□ 2.2
PPP4R4-202ENST00000328839 OSBPL7Q9BZF2 842 aa28.8■■■□□ 2.2
PPP4R4-202ENST00000328839 PSTPIP2Q9H939 334 aa28.8■■■□□ 2.2
PPP4R4-202ENST00000328839 BDP1A6H8Y1 2624 aa28.79■■■□□ 2.2
PPP4R4-202ENST00000328839 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa28.79■■■□□ 2.2
PPP4R4-202ENST00000328839 CALM1P0DP23 149 aa28.79■■■□□ 2.2
PPP4R4-202ENST00000328839 CALM2P0DP24 149 aa28.79■■■□□ 2.2
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