RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 MOXD1Q6UVY6 613 aa18.24■□□□□ 0.51
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CHTF18-202ENST00000317063 EHMT1Q9H9B1 1298 aa18.24■□□□□ 0.51
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CHTF18-202ENST00000317063 ASTN1O14525 1302 aa18.22■□□□□ 0.51
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CHTF18-202ENST00000317063 NR3C2P08235 984 aa18.21■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 FKBP1BP68106 108 aa18.21■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 GRM1Q13255 1194 aa18.21■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 PCNX4Q63HM2 1172 aa18.21■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 RIOX2Q8IUF8 465 aa18.21■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF592Q92610 1267 aa18.21■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 FAM20AQ96MK3 541 aa18.21■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa18.21■□□□□ 0.51
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CHTF18-202ENST00000317063 GTF2A2P52657 109 aa18.21■□□□□ 0.51
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CHTF18-202ENST00000317063 POTEGQ6S5H5 508 aa18.21■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 OTOP1Q7RTM1 612 aa18.21■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 AOPEPQ8N6M6 819 aa18.21■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 LCTP09848 1927 aa18.21■□□□□ 0.51
CHTF18-202ENST00000317063 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP18.21■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 IQCB1Q15051 598 aa18.21■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 CATSPER3Q86XQ3 398 aa18.21■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 CEP120Q8N960 986 aa18.21■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 PORCNQ9H237 461 aa18.21■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa18.21■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 ZBTB39O15060 712 aa18.2■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 GAS7O60861 476 aa18.2■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 PSMD10O75832 226 aa18.2■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 TNNT1P13805 278 aa18.2■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 DYMQ7RTS9 669 aa18.2■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 MB21D1Q8N884 522 aa18.2■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 RASSF4Q9H2L5 321 aa18.2■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 POLD4Q9HCU8 107 aa18.2■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 PNMA2Q9UL42 364 aa18.2■□□□□ 0.5
CHTF18-202ENST00000317063 TRPM7Q96QT4 1865 aa18.2■□□□□ 0.5
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