RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 SLC37A4O43826 429 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 METTL7BQ6UX53 244 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 MBOAT7Q96N66 472 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXD4-201ENST00000306324 WNT7AO00755 349 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 MSH4O15457 936 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 CAPN15O75808 1086 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 CST5P28325 142 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 NKX3-2P78367 333 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 KCNA10Q16322 511 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 HSDL1Q3SXM5 330 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 MTMR6Q9Y217 621 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 A6NJR5 290 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 NOP56O00567 594 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 ZEB2O60315 1214 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 PPTC7Q8NI37 304 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 NFASCO94856 1347 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 ASGR1P07306 291 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 MMP3P08254 477 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 POTEDQ86YR6 584 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 WDR81Q562E7 1941 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 MYH15Q9Y2K3 1946 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 MYL3P08590 195 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 MCM7P33993 719 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 TRAPPC10P48553 1259 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 ACLYP53396 1101 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 TTC38Q5R3I4 469 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 GJA10Q969M2 543 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 FERMT2Q96AC1 680 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 TBC1D22BQ9NU19 505 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 SLC9A2Q9UBY0 812 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 MOXD2PA6NHM9 499 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 MARCH6O60337 910 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 NEMFO60524 1076 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 NBR1Q14596 966 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF174Q15697 407 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 BRAPQ7Z569 592 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 TELO2Q9Y4R8 837 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 DHX15O43143 795 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 DGKDQ16760 1214 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 RILPL1Q5EBL4 403 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 LRCH2Q5VUJ6 765 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 CXCL17Q6UXB2 119 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 NECAB2Q7Z6G3 386 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 ETNPPLQ8TBG4 499 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 SLC5A5Q92911 643 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 GPR20Q99678 358 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 GAS7O60861 476 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 C11orf49Q9H6J7 331 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 KCNMB3Q9NPA1 279 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 POLR3EQ9NVU0 708 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 PHF24Q9UPV7 400 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1W2PQY0 241 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 RESTQ13127 1097 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 CALCRLQ16602 461 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 VTI1AQ96AJ9 217 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 RIT2Q99578 217 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 TEKT3Q9BXF9 490 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 TBX3O15119 743 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 KPNA6O60684 536 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 PPFIA4O75335 1185 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 BAG4O95429 457 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 PURAQ00577 322 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 PKP1Q13835 747 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 FAM20AQ96MK3 541 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 GLT1D1Q96MS3 346 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF286BP0CG31 522 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 COL6A1P12109 1028 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 ACTR2P61160 394 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 SLFN12Q8IYM2 578 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 SEPT1Q8WYJ6 367 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 HAS1Q92839 578 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXD4-201ENST00000306324 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
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