RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304743.6

PCNX1-201, Transcript of pecanex 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PCNX1, Length 12,919 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-201ENST00000304743 MID2Q9UJV3 735 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 RTL1A6NKG5 1358 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 IKBKBO14920 756 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 CES1P23141 567 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 MPP6Q9NZW5 540 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 A0A087X0T9 212 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 GNPATO15228 680 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 LRMPQ12912 555 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 DCUN1D1Q96GG9 259 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 SERPINI1Q99574 410 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 PSMD14O00487 310 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 BFSP2Q13515 415 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 CCDC142Q17RM4 750 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 GRAMD4Q6IC98 578 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 KRT28Q7Z3Y7 464 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 VPS16Q9H269 839 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 AMFRQ9UKV5 643 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 LRRD1A4D1F6 860 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 RPS6KA1Q15418 735 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 COBLO75128 1261 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 PIK3CAP42336 1068 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 KLHL30Q0D2K2 578 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 MYO1EQ12965 1108 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 TOMM20Q15388 145 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 APBA3O96018 575 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 TP53BP2Q13625 1128 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 RFX6Q8HWS3 928 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 DENND2AQ9ULE3 1009 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 CYBBP04839 570 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 TAC1P20366 129 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 KRT76Q01546 638 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 NBPF1Q3BBV0 1214 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 C10orf53Q8N6V4 93 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 ZNF280CQ8ND82 737 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 USP6NLQ92738 828 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 COPG2Q9UBF2 871 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 MPOP05164 745 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 VCAM1P19320 739 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 DENND6AQ8IWF6 608 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 ALAS1P13196 640 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 KLC2Q9H0B6 622 aa8.7□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 CAMK1Q14012 370 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 BEND3Q5T5X7 828 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 ADCK1Q86TW2 530 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 SORBS3O60504 671 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 MIIPQ5JXC2 388 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 GAS2L3Q86XJ1 694 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 RFWD2Q8NHY2 731 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 TUFT1Q9NNX1 390 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 AATKQ6ZMQ8 1374 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 YWHAQP27348 245 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 TCEAL5Q5H9L2 206 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 KLHL7Q8IXQ5 586 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 KRT20P35900 424 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 SCYL3Q8IZE3 742 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 MAGEB5Q9BZ81 275 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 CCDC61Q9Y6R9 512 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 MCTP2Q6DN12 878 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 MOSPD2Q8NHP6 518 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 RPN2P04844 631 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 ASAP3Q8TDY4 903 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 RABGGTAQ92696 567 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 SPACA6W5XKT8 324 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 RAPGEF5Q92565 580 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 SKA1Q96BD8 255 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 PDCD10Q9BUL8 212 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 ZRANB1Q9UGI0 708 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 STON1Q9Y6Q2 735 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 MCF2LO15068 1137 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 EPB42P16452 691 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 SLC16A1P53985 500 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 DENND3A2RUS2 1198 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 DDHD2O94830 711 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 JAK1P23458 1154 aa8.69□□□□□ -1.02
PCNX1-201ENST00000304743 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 120 ms