RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299578.9

C16orf46-201, Transcript of chromosome 16 open reading frame 46, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene C16orf46, Length 1,605 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf46-201ENST00000299578 SEMA3FQ13275 785 aa13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 LY6KQ17RY6 165 aa13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 LETM2Q2VYF4 491 aa13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 NIPA1Q7RTP0 329 aa13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 TLK2Q86UE8 772 aa13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 NOSTRINQ8IVI9 506 aa13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 CDHR1Q96JP9 859 aa13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 MEIS1O00470 390 aa13.49□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 TFRCP02786 760 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 PTGS1P23219 599 aa13.49□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP13.49□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 PRR16Q569H4 304 aa13.49□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 PLA2G4DQ86XP0 818 aa13.49□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 COPS5Q92905 334 aa13.49□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa13.49□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 AP5M1Q9H0R1 490 aa13.49□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 NUP62CLQ9H1M0 184 aa13.49□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 SPC25Q9HBM1 224 aa13.49□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 KCNH7Q9NS40 1196 aa13.49□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 OGDHLQ9ULD0 1010 aa13.49□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 Q9Y3F1 56 aa13.49□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa13.48□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 POTEFA5A3E0 1075 aa13.48□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 MAFGO15525 162 aa13.48□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 EDIL3O43854 480 aa13.48□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 TDP2O95551 362 aa13.48□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 PGK1P00558 417 aa13.48□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 GH1P01241 217 aa13.48□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 SP2Q02086 613 aa13.48□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 MOXD1Q6UVY6 613 aa13.48□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 OR6J1Q8NGC5 347 aa13.48□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 PKD2L1Q9P0L9 805 aa13.48□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa13.47□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 SORBS3O60504 671 aa13.47□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 ADAMTS4O75173 837 aa13.47□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 GGPS1O95749 300 aa13.47□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 ARP10275 920 aa13.47□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 CAPN2P17655 700 aa13.47□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 CYP3A7P24462 503 aa13.47□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 SOX10P56693 466 aa13.47□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 GJA9P57773 515 aa13.47□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 NEDD9Q14511 834 aa13.47□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 RNF180Q86T96 592 aa13.47□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 PDLIM2Q96JY6 352 aa13.47□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 SENP7Q9BQF6 1050 aa13.47□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 FUCA2Q9BTY2 467 aa13.47□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 DNAH12Q6ZR08 3092 aa13.47□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 CCDC192P0DO97 292 aa13.46□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 KCNA2P16389 499 aa13.46□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 LIG1P18858 919 aa13.46□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 ARHGAP1Q07960 439 aa13.46□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 LRRC41Q15345 812 aa13.46□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 Q4G0T1 1027 aa13.46□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 HS1BP3Q53T59 392 aa13.46□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 PPP4R3AQ6IN85 833 aa13.46□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 ARRDC4Q8NCT1 418 aa13.46□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 LENG9Q96B70 501 aa13.46□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 MBOAT7Q96N66 472 aa13.46□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
C16orf46-201ENST00000299578 MYADML2A6NDP7 307 aa13.46□□□□□ -0.26
C16orf46-201ENST00000299578 KBTBD13C9JR72 458 aa13.46□□□□□ -0.26
C16orf46-201ENST00000299578 SLC37A4O43826 429 aa13.46□□□□□ -0.26
C16orf46-201ENST00000299578 ATP9AO75110 1047 aa13.46□□□□□ -0.26
C16orf46-201ENST00000299578 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.26
C16orf46-201ENST00000299578 YEATS4O95619 227 aa13.46□□□□□ -0.26
C16orf46-201ENST00000299578 EN2P19622 333 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.26
C16orf46-201ENST00000299578 ATP2B1P20020 1258 aa13.46□□□□□ -0.26
C16orf46-201ENST00000299578 CST5P28325 142 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.26
C16orf46-201ENST00000299578 CPT1AP50416 773 aa13.46□□□□□ -0.26
C16orf46-201ENST00000299578 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.26
C16orf46-201ENST00000299578 BEX3Q00994 111 aa13.46□□□□□ -0.26
C16orf46-201ENST00000299578 LAMC2Q13753 1193 aa13.46□□□□□ -0.26
C16orf46-201ENST00000299578 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
C16orf46-201ENST00000299578 TPRNQ4KMQ1 711 aa13.46□□□□□ -0.26
C16orf46-201ENST00000299578 METTL7BQ6UX53 244 aa13.46□□□□□ -0.26
C16orf46-201ENST00000299578 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
C16orf46-201ENST00000299578 CYFIP1Q7L576 1253 aa13.46□□□□□ -0.26
C16orf46-201ENST00000299578 SPATA33Q96N06 139 aa13.46□□□□□ -0.26
C16orf46-201ENST00000299578 USP28Q96RU2 1077 aa13.46□□□□□ -0.26
C16orf46-201ENST00000299578 SDF4Q9BRK5 362 aa13.46□□□□□ -0.26
C16orf46-201ENST00000299578 ZNF577Q9BSK1 485 aa13.46□□□□□ -0.26
C16orf46-201ENST00000299578 TNMDQ9H2S6 317 aa13.46□□□□□ -0.26
C16orf46-201ENST00000299578 CLSTN2Q9H4D0 955 aa13.46□□□□□ -0.26
C16orf46-201ENST00000299578 MLXIPQ9HAP2 919 aa13.46□□□□□ -0.26
C16orf46-201ENST00000299578 POLR3EQ9NVU0 708 aa13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms