RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 MYO6Q9UM54 1294 aa22.24■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 HLA-DOAP06340 250 aa22.23■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 MMP10P09238 476 aa22.23■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 PPP1R2P41236 205 aa22.23■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 TUBB4BP68371 445 aa22.23■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 CALCRLQ16602 461 aa22.23■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 CCDC122Q5T0U0 273 aa22.23■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 WLSQ5T9L3 541 aa22.23■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 RETREG2Q8NC44 543 aa22.23■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 CALML4Q96GE6 196 aa22.23■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22.23■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.23■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.23■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 PSMD14O00487 310 aa22.23■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 NDUFAB1O14561 156 aa22.23■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 SLC37A4O43826 429 aa22.23■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 KIAA0754O94854 1291 aa22.23■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.23■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.23■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 MASTLQ96GX5 879 aa22.23■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 PNMA5Q96PV4 448 aa22.23■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 NUP58Q9BVL2 599 aa22.23■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.23■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 RCCD1A6NED2 376 aa22.22■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 TDP2O95551 362 aa22.22■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 CALRP27797 417 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.22■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.22■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 ZNF662Q6ZS27 426 aa22.22■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 FMNL3Q8IVF7 1028 aa22.22■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 DUSP10Q9Y6W6 482 aa22.22■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.22■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 SLURP2P0DP57 97 aa22.22■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 CYP27A1Q02318 531 aa22.22■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 CRYMQ14894 314 aa22.22■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 CENPPQ6IPU0 288 aa22.22■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.22■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 CAPZA3Q96KX2 299 aa22.22■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 LACRTQ9GZZ8 138 aa22.22■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.22■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 MYMKA6NI61 221 aa22.21■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 CRKP46108 304 aa22.21■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 ZBED6P86452 979 aa22.21■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 CCDC96Q2M329 555 aa22.21■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 CEP85LQ5SZL2 805 aa22.21■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 ERGIC2Q96RQ1 377 aa22.21■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 STK17AQ9UEE5 414 aa22.21■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.21■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.21■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 PDCLQ13371 301 aa22.21■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 SV2BQ7L1I2 683 aa22.21■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 DYMQ7RTS9 669 aa22.21■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.21■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HPS6-201ENST00000299238 SCN9AQ15858 1988 aa22.2■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 TNNI2P48788 182 aa22.2■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 USP14P54578 494 aa22.2■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 KIAA1328Q86T90 577 aa22.2■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.2■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 UIMC1Q96RL1 719 aa22.2■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 SELENOOQ9BVL4 669 aa22.2■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.2■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.2■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 UBE2SQ16763 222 aa22.2■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 FIGNQ5HY92 759 aa22.2■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 SLC16A2P36021 539 aa22.19■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 KRT83P78385 493 aa22.19■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 E2F5Q15329 346 aa22.19■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.19■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 UNC13DQ70J99 1090 aa22.19■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 DNAJC18Q9H819 358 aa22.19■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 A0A1W2PQJ5 194 aa22.19■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 GOLGA6BA6NDN3 693 aa22.19■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 POTEMA6NI47 508 aa22.19■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 KCTD1Q719H9 257 aa22.19■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 GJA10Q969M2 543 aa22.19■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.18■■□□□ 1.14
HPS6-201ENST00000299238 TUBBP07437 444 aa22.18■■□□□ 1.14
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