RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 FIBPO43427 364 aa22.62■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 EFCAB14O75071 495 aa22.62■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 MCM5P33992 734 aa22.62■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 THPOP40225 353 aa22.62■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 SEMA3FQ13275 785 aa22.62■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 METTL7BQ6UX53 244 aa22.62■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 TMTC2Q8N394 836 aa22.62■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.62■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 USP26Q9BXU7 913 aa22.62■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 EMSYQ7Z589 1322 aa22.61■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC69A6NI79 296 aa22.61■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.61■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 MEIS2O14770 477 aa22.61■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 LGR5O75473 907 aa22.61■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 GJB5O95377 273 aa22.61■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.61■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 RSPH10BP0C881 870 aa22.61■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.61■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.61■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 HOXC8P31273 242 aa22.61■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 GNAQP50148 359 aa22.61■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 TFF2Q03403 129 aa22.61■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 GRB10Q13322 594 aa22.61■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.61■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM87BQ96K49 555 aa22.61■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 GPR20Q99678 358 aa22.61■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.61■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.61■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 PIK3CDO00329 1044 aa22.6■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 SLC27A2O14975 620 aa22.6■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 RXRAP19793 462 aa22.6■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 RAD9AQ99638 391 aa22.6■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 TTC28Q96AY4 2481 aa22.59■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 TREHO43280 583 aa22.59■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.59■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.59■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.59■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.59■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.59■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 LPXNO60711 386 aa22.58■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 CALM1P0DP23 149 aa22.58■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 CALM2P0DP24 149 aa22.58■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 CALM3P0DP25 149 aa22.58■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 LIFRP42702 1097 aa22.58■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 SP4Q02446 784 aa22.58■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 AAK1Q2M2I8 961 aa22.58■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 NLRX1Q86UT6 975 aa22.58■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 TRIM50Q86XT4 487 aa22.58■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.58■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 SETD4Q9NVD3 440 aa22.58■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 TRANK1O15050 2925 aa22.57■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 BMP1P13497 986 aa22.57■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 NECTIN1Q15223 517 aa22.57■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.57■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.57■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.57■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.57■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 LINC01553A4QN01 128 aa22.56■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 AMHP03971 560 aa22.56■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 CTSHP09668 335 aa22.56■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 GNAT1P11488 350 aa22.56■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 KCNQ1P51787 676 aa22.56■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.56■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.56■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.56■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.56■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.56■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.55■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 CAND2O75155 1236 aa22.55■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 ERVK-21P61565 698 aa22.55■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.55■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.55■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 GPRASP2Q96D09 838 aa22.55■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.55■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 COG5Q9UP83 839 aa22.55■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 INSL6Q9Y581 213 aa22.55■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 REV3LO60673 3130 aa22.54■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.54■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 FANCBQ8NB91 859 aa22.54■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 SEPT8Q92599 483 aa22.54■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.54■■□□□ 1.2
CXCL3-201ENST00000296026 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.54■■□□□ 1.2
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