RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 POTEDQ86YR6 584 aa14.99□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.99□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 SLC5A5Q92911 643 aa14.99□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF577Q9BSK1 485 aa14.99□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 AP5M1Q9H0R1 490 aa14.99□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 TBC1D22BQ9NU19 505 aa14.99□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa14.99□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 MYADML2A6NDP7 307 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 A6NJR5 290 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 NEMFO60524 1076 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 BRD1O95696 1058 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 F13A1P00488 732 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 ATP2B1P20020 1258 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 LRRC41Q15345 812 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 RNF180Q86T96 592 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 ARRDC4Q8NCT1 418 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 PPTC7Q8NI37 304 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 FAM20AQ96MK3 541 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 RIT2Q99578 217 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 SDF4Q9BRK5 362 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 MLXIPQ9HAP2 919 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 PKD2L1Q9P0L9 805 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 TCHHQ07283 1943 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 DNM1LO00429 736 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 PSMD10O75832 226 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 MCM7P33993 719 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 CPT1AP50416 773 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 HSDL1Q3SXM5 330 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 AFG1LQ8WV93 481 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 HAS1Q92839 578 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 SPATA33Q96N06 139 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 MTMR9Q96QG7 549 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 SLC9A2Q9UBY0 812 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 ZDHHC9Q9Y397 364 aa14.98□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 MMP3P08254 477 aa14.97□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 NBR1Q14596 966 aa14.97□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF174Q15697 407 aa14.97□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 CALCRLQ16602 461 aa14.97□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 GNASQ5JWF2 1037 aa14.97□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 LRCH2Q5VUJ6 765 aa14.97□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 B3GNT9Q6UX72 402 aa14.97□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 SLFN12Q8IYM2 578 aa14.97□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 GPR20Q99678 358 aa14.97□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM60Q9H2L4 133 aa14.97□□□□□ -0.01
CCDC42-201ENST00000293845 MOXD2PA6NHM9 499 aa14.96□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 LAD1O00515 517 aa14.96□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 NOP56O00567 594 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 ZEB2O60315 1214 aa14.96□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 GAS7O60861 476 aa14.96□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 PPFIA4O75335 1185 aa14.96□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 NUCB2P80303 420 aa14.96□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 BEX3Q00994 111 aa14.96□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 KRT76Q01546 638 aa14.96□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 FAM173BQ6P4H8 233 aa14.96□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 C4orf32Q8N8J7 132 aa14.96□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 TEKT3Q9BXF9 490 aa14.96□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 PHF24Q9UPV7 400 aa14.96□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 ELP1O95163 1332 aa14.95□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa14.95□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 KBTBD13C9JR72 458 aa14.95□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 SORBS3O60504 671 aa14.95□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 KPNA6O60684 536 aa14.95□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 ATG7O95352 703 aa14.95□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 BAG4O95429 457 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 BMP15O95972 392 aa14.95□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 CCNE2O96020 404 aa14.95□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 OR52Z1P0C646 297 aa14.95□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 PTGDRQ13258 359 aa14.95□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 PPP2R5CQ13362 524 aa14.95□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 KCNA10Q16322 511 aa14.95□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 DGKDQ16760 1214 aa14.95□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 SEPT1Q8WYJ6 367 aa14.95□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 GJA10Q969M2 543 aa14.95□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 UIMC1Q96RL1 719 aa14.95□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.95□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa14.95□□□□□ -0.02
CCDC42-201ENST00000293845 VAV3Q9UKW4 847 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms