RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 MLXIPQ9HAP2 919 aa24.72■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 MOXD1Q6UVY6 613 aa24.72■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 CXCL17Q6UXB2 119 aa24.72■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 NEK8Q86SG6 692 aa24.72■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 SPATA33Q96N06 139 aa24.72■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 TELO2Q9Y4R8 837 aa24.72■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 KIF28PB7ZC32 967 aa24.71■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 PURAQ00577 322 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 LETM2Q2VYF4 491 aa24.71■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 MBOAT7Q96N66 472 aa24.71■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 FOXD4L1Q9NU39 408 aa24.71■■□□□ 1.55
SLC25A39-201ENST00000225308 ZEB2O60315 1214 aa24.7■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 NFASCO94856 1347 aa24.7■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 Q4G0T1 1027 aa24.69■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 PPP4R3AQ6IN85 833 aa24.69■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 NOSTRINQ8IVI9 506 aa24.69■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 GLT1D1Q96MS3 346 aa24.69■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 POLR3EQ9NVU0 708 aa24.69■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 WDR81Q562E7 1941 aa24.69■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 DHX15O43143 795 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 UIMC1Q96RL1 719 aa24.68■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 ELP1O95163 1332 aa24.68■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 H3BQV1 296 aa24.68■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 WNT7AO00755 349 aa24.68■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC37A4O43826 429 aa24.68■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 MYL3P08590 195 aa24.68■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 SP4Q02446 784 aa24.68■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 DGKDQ16760 1214 aa24.68■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 GPR20Q99678 358 aa24.68■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF577Q9BSK1 485 aa24.68■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 STARD7Q9NQZ5 370 aa24.68■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 NOP56O00567 594 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 MSH4O15457 936 aa24.67■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 PPFIA4O75335 1185 aa24.67■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 SNX17Q15036 470 aa24.67■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 LRRC26Q2I0M4 334 aa24.67■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa24.67■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 SDF4Q9BRK5 362 aa24.67■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 KPNA6O60684 536 aa24.66■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 CABYRO75952 493 aa24.66■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 ETNPPLQ8TBG4 499 aa24.66■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC9A2Q9UBY0 812 aa24.66■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF286BP0CG31 522 aa24.65■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 PDCP20941 246 aa24.65■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 C1orf53Q5VUE5 145 aa24.65■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 KAT2BQ92831 832 aa24.65■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 GJA10Q969M2 543 aa24.65■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 HTATIP2Q9BUP3 242 aa24.65■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 GRIN2DO15399 1336 aa24.65■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 PSMC6P62333 389 aa24.64■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 MCTP1Q6DN14 999 aa24.64■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC5A5Q92911 643 aa24.64■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 TBC1D22BQ9NU19 505 aa24.64■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
SLC25A39-201ENST00000225308 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa24.64■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 CCNE2O96020 404 aa24.64■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 F2P00734 622 aa24.64■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 SYT1P21579 422 aa24.64■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 VTI1AQ96AJ9 217 aa24.64■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 C16orf70Q9BSU1 422 aa24.64■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 KCNMB3Q9NPA1 279 aa24.64■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 LGALS2P05162 132 aa24.63■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 POTEDQ86YR6 584 aa24.63■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 RIT2Q99578 217 aa24.63■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 ACTR2P61160 394 aa24.62■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 ITGA7Q13683 1181 aa24.62■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 TRIM50Q86XT4 487 aa24.62■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC43A3Q8NBI5 491 aa24.62■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 SEPT1Q8WYJ6 367 aa24.62■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 KAT6AQ92794 2004 aa24.62■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 PSMD10O75832 226 aa24.61■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 CDK7P50613 346 aa24.61■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 RTP1P59025 263 aa24.61■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 TRIM60Q495X7 471 aa24.61■■□□□ 1.53
SLC25A39-201ENST00000225308 HAS1Q92839 578 aa24.61■■□□□ 1.53
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