RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000207178.1

Lmo1-202, Transcript of Rhombotin-1, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene Lmo1, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1-202ENSMUST00000207178 9230110C19RikQ8CC70 267 aa22.17■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Rbm8aQ9CWZ3 174 aa22.17■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Suclg2Q9Z2I8 433 aa22.17■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Kpna6O35345 536 aa22.16■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Pde6aP27664 859 aa22.16■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Bpifa6Q0VGU8 367 aa22.16■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Dennd1bQ3U1T9 766 aa22.16■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Ahcyl2Q68FL4 613 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Colgalt2Q6NVG7 625 aa22.16■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Cpa4Q6P8K8 420 aa22.16■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Hps6Q8BLY7 805 aa22.16■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Glis1Q8K1M4 789 aa22.16■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Camkk1Q8VBY2 505 aa22.16■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Dnajc18Q9CZJ9 357 aa22.16■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 WtapQ9ER69 396 aa22.16■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Fmnl1Q9JL26 1094 aa22.16■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Prr22F6TNE3 422 aa22.15■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Nfil3O08750 462 aa22.15■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Itgb5O70309 798 aa22.15■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Mtco1P00397 514 aa22.15■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Mov10P23249 1004 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Cyp2f2P33267 491 aa22.15■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Mtx1P47802 317 aa22.15■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Ifit2Q64112 472 aa22.15■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Ccp110Q7TSH4 1004 aa22.15■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Nrip1Q8CBD1 1161 aa22.15■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Ushbp1Q8R370 680 aa22.15■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Cog6Q8R3I3 657 aa22.15■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Rfc2Q9WUK4 349 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Gm4758L7N258 96 aa22.14■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 CenpbP27790 599 aa22.14■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Lbx1P52955 282 aa22.14■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Jakmip3Q5DTN8 844 aa22.14■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Znrf3Q5SSZ7 913 aa22.14■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Antxr2Q6DFX2 487 aa22.14■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Cyfip1Q7TMB8 1253 aa22.14■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Clstn3Q99JH7 956 aa22.14■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 SdhbQ9CQA3 282 aa22.14■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Pold3Q9EQ28 462 aa22.14■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Smchd1Q6P5D8 2007 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 ChgaP26339 463 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Resp18P47939 175 aa22.13■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Pald1P70261 859 aa22.13■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Q6P2K3 674 aa22.13■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Inppl1Q6P549 1257 aa22.13■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Zmym6Q8BS54 1249 aa22.13■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Supt16hQ920B9 1047 aa22.13■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Npm3Q9CPP0 175 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Odf2lQ9D478 642 aa22.13■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Mlh1Q9JK91 760 aa22.13■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Cnpy2Q9QXT0 182 aa22.13■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Umodl1Q5DID3 1319 aa22.12■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Col4a3Q9QZS0 1669 aa22.12■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Smim10l2aA0A0B4J1F8 78 aa22.12■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Tnfaip1O70479 316 aa22.12■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Kcnj6P48542 425 aa22.12■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Smad4P97471 551 aa22.12■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Ctnnb1Q02248 781 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 RubcnlQ3TD16 648 aa22.12■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Nlrx1Q3TL44 975 aa22.12■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Armc2Q3URY6 854 aa22.12■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 C6.1alQ7M757 291 aa22.12■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Colgalt1Q8K297 617 aa22.12■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Nrbp1Q99J45 535 aa22.12■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Rassf3Q99P51 232 aa22.12■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 FibpQ9JI19 357 aa22.12■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Col4a6B1AVK5 1691 aa22.11■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Gm3252E9PUT9 216 aa22.11■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Gm3468E9QAJ8 216 aa22.11■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Gm29094F6Q785 221 aa22.11■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 FasP25446 327 aa22.11■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Pdia3P27773 505 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Nkx1-2P42580 305 aa22.11■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Cnnm3Q32NY4 713 aa22.11■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Fam196aQ3USH1 422 aa22.11■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 VcpkmtQ8C436 228 aa22.11■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Tbc1d13Q8R3D1 400 aa22.11■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Drap1Q9D6N5 205 aa22.11■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Rgs2O08849 211 aa22.1■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Grin2cQ01098 1239 aa22.1■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Ttc9Q3V038 219 aa22.1■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Dusp11Q6NXK5 321 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Mtmr10Q7TPM9 771 aa22.1■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Rem2Q8VEL9 341 aa22.1■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Asah2Q9JHE3 756 aa22.1■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Tmem191cQ9JJB1 302 aa22.1■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Tnrc18Q80WC3 2878 aa22.1■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Ankrd16A2AS55 361 aa22.09■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Traf3ip1Q149C2 625 aa22.09■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 ErmnQ5EBJ4 281 aa22.09■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Ddr2Q62371 854 aa22.09■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Wdr44Q6NVE8 915 aa22.09■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Cdca8Q8BHX3 289 aa22.09■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Gpc5Q8CAL5 572 aa22.09■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Vwa1Q8R2Z5 415 aa22.09■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 GlulP15105 373 aa22.08■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Tdo2P48776 406 aa22.08■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Tmtc2Q56A06 836 aa22.08■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 FcgrtQ61559 365 aa22.08■■□□□ 1.13
Lmo1-202ENSMUST00000207178 Paf1Q8K2T8 535 aa22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.6 ms