RNA–Protein interactions for RNA: YOR003W

YSP3, Transcript of Putative precursor to the subtilisin-like protease III, yeast

Gene YSP3, Length 1,437 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YSP3	YOR003W	YHR210C	P38893	341 aa		10.13	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	MRX1	P40050	688 aa		10.13	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	FMN1	Q03778	218 aa		10.13	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	APC4	Q04601	652 aa		10.13	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	UAF30	Q08747	228 aa		10.13	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	JLP1	Q12358	412 aa		10.13	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	SAS5	Q99314	248 aa		10.13	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	COR1	P07256	457 aa		10.12	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	SPO23	P33757	523 aa		10.12	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.12	□□□□□ -0.79	RIP-Chip
YSP3	YOR003W	PMT3	P47190	753 aa		10.12	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	MUP1	P50276	574 aa		10.12	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	YGR266W	P53326	701 aa		10.12	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	IRC15	Q02733	499 aa		10.12	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	VPS16	Q03308	798 aa		10.12	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	ECM11	Q04110	302 aa		10.12	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	CDA1	Q06702	301 aa		10.12	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	XYL2	Q07993	356 aa		10.12	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	CSF1	Q12150	2958 aa		10.11	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	PRI2	P20457	528 aa		10.11	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	PHO87	P25360	923 aa		10.11	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	MXR2	P25566	168 aa		10.11	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	SIN4	P32259	974 aa		10.11	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	OMA1	P36163	345 aa		10.11	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	BNA4	P38169	460 aa		10.11	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	MTG2	P38860	518 aa		10.11	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	HOC1	P47124	396 aa		10.11	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	UBP2	Q01476	1272 aa		10.11	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	TEN1	Q07921	160 aa		10.11	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	PUS9	Q12069	462 aa		10.11	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	NTO1	Q12311	748 aa		10.11	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	FRE7	Q12333	620 aa		10.11	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	ARG81	P05085	880 aa		10.1	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	ATP4	P05626	244 aa		10.1	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	FRE2	P36033	711 aa		10.1	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	FRT2	P39734	528 aa		10.1	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	RAD17	P48581	401 aa		10.1	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	YML119W	Q03208	357 aa		10.1	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	YMR010W	Q03687	405 aa		10.1	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	YDR338C	Q05497	695 aa		10.1	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		10.1	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	ALG7	P07286	448 aa		10.09	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	VPS33	P20795	691 aa		10.09	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	CCA1	P21269	546 aa		10.09	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	CAB3	P36076	571 aa		10.09	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	AYR1	P40471	297 aa		10.09	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	RSF1	Q05043	376 aa		10.09	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
YSP3	YOR003W	NPR1	P22211	790 aa		10.08	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	SEC17	P32602	292 aa		10.08	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	TOA1	P32773	286 aa		10.08	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	OAR1	P35731	278 aa		10.08	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	FMP52	P40008	231 aa		10.08	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	FAU1	P40099	211 aa		10.08	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	MPS3	P47069	682 aa		10.08	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	IMA1	P53051	589 aa		10.08	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	USE1	P53146	245 aa		10.08	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	MNN2	P38069	597 aa		10.07	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	STE24	P47154	453 aa		10.07	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	GET4	Q12125	312 aa		10.07	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	SNF8	Q12483	233 aa		10.07	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	PHO81	P17442	1178 aa		10.07	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	DGR2	P32330	852 aa		10.07	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	YMC1	P32331	307 aa		10.07	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	RPS27B	P38711	82 aa		10.07	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	PMT4	P46971	762 aa		10.07	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	GAD1	Q04792	585 aa		10.07	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	YLR413W	Q06689	675 aa		10.07	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	YPR202W	Q08993	238 aa		10.07	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	STE7	P06784	515 aa		10.06	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	UNG1	P12887	359 aa		10.06	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	URA4	P20051	364 aa		10.06	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	SSO1	P32867	290 aa		10.06	□□□□□ -0.8
YSP3	YOR003W	GLG1	P36143	616 aa		10.06	□□□□□ -0.8

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