RNA–Protein interactions for RNA: YNL077W

APJ1, Transcript of Chaperone with a role in SUMO-mediated protein degradation, yeast

Gene APJ1, Length 1,587 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APJ1	YNL077W	HXT4	P32467	576 aa		4.94	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	BAP2	P38084	609 aa		4.94	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YBL029W	P38201	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	BMT2	P38278	337 aa		4.94	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	HXT7	P39004	570 aa		4.94	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	USE1	P53146	245 aa		4.94	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YET2	Q04210	160 aa		4.94	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YML096W	Q04489	525 aa		4.94	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	DST1	P07273	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	OCA4	P25366	362 aa		4.93	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	MEI5	P32489	222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	EMC3	P36039	253 aa		4.93	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	UTH1	P36135	365 aa		4.93	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	GGC1	P38988	300 aa		4.93	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	LTP1	P40347	161 aa		4.93	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	HXT16	P47185	567 aa		4.93	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	NAS6	P50086	228 aa		4.93	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YGR053C	P53234	283 aa		4.93	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	MPS1	P54199	764 aa		4.93	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	HXT15	P54854	567 aa		4.93	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	HOT1	Q03213	719 aa		4.93	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	PLB2	Q03674	706 aa		4.93	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	SPC24	Q04477	213 aa		4.93	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	DAL4	Q04895	635 aa		4.93	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	EAF1	Q06337	982 aa		4.93	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	NUM1	Q00402	2748 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	SNF5	P18480	905 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	RPC82	P32349	654 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	STE14	P32584	239 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	DOM34	P33309	386 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	FRE2	P36033	711 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	CAF4	P36130	643 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	ARA1	P38115	344 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YBR071W	P38243	211 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	TSC10	P38342	320 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YHR219W	P38900	624 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	CAB2	P40506	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	AZF1	P41696	914 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	PTR3	P43606	678 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	MET12	P46151	657 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	GTR1	Q00582	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	SPO19	Q03029	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YDR124W	Q04608	324 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	GTB1	Q04924	702 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	CDA1	Q06702	301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	SGT1	Q08446	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	UAF30	Q08747	228 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YPR202W	Q08993	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	HUA2	Q12134	243 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	SAS5	Q99314	248 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	CMP2	P14747	604 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	DGR2	P32330	852 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YME2	P32843	850 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	SFC1	P33303	322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	CCZ1	P38273	704 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YHR033W	P38690	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	AXL2	P38928	823 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
APJ1	YNL077W	PLB1	P39105	664 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	ERV46	P39727	415 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	MEP2	P41948	499 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	IMA1	P53051	589 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	SLI1	P53304	468 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	MET31	Q03081	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	ECM11	Q04110	302 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	ORM2	Q06144	216 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YLR413W	Q06689	675 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	OSW1	Q08692	278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	PUS9	Q12069	462 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YOR114W	Q12219	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.3 ms