RNA–Protein interactions for RNA: YMR134W

ERG29, Transcript of Protein of unknown function involved in ergosterol biosynthesis, yeast

Gene ERG29, Length 714 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ERG29	YMR134W	CYC3	P06182	269 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	ATP10	P18496	279 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	SLY1	P22213	666 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	MRE11	P32829	692 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	CBS1	P14066	229 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	KAR9	P32526	644 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	THI2	P38141	450 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	RTS3	P53289	263 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.04	□□□□□ -1.92	not detected
ERG29	YMR134W	MCM10	P32354	571 aa		3.04	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	ECM25	P32525	599 aa		3.04	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	NPL6	P32832	435 aa		3.04	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	GYP6	P32806	458 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	DSL1	P53847	754 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	YDR239C	Q03780	787 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	SEC39	Q12745	709 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ERG29	YMR134W	SEM1	O94742	89 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	RHO2	P06781	192 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	REC114	P32841	428 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	CSE2	P33308	149 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	DOT5	P40553	215 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	YNR048W	P53740	393 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	YDR387C	Q04162	555 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	TAP42	Q04372	366 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	TOP1	P04786	769 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	SNT1	P25357	1226 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	DPB3	P27344	201 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	AFG1	P32317	509 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	YKL097C	P34245	136 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	ECM27	P47144	725 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	FRE4	P53746	719 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	CCH1	P50077	2039 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	SSH4	P32343	579 aa		3	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	CST26	P38226	397 aa		3	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	VHS1	Q03785	461 aa		3	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	IES4	Q08561	116 aa		3	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	YLR278C	Q05854	1341 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	FOB1	O13329	566 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	MIG3	P39943	394 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	PLP2	Q12017	286 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	AHC1	Q12433	566 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	RAD14	P28519	371 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	SEO1	P39709	593 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	DFG10	P40526	253 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	YGR149W	P48236	432 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	HSP31	Q04432	237 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	YPQ1	Q12010	308 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	YRM1	Q12340	786 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	IZH2	Q12442	317 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	PRB1	P09232	635 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	AAC3	P18238	307 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	NIP100	P33420	868 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	MET28	P40573	187 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	TWF1	P53250	332 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	VPS75	P53853	264 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	IGO1	P53897	168 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	ENT1	Q12518	454 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	YML133C	Q03099	1374 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	YLL067C	Q07888	1374 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	YLL066C	Q99208	1374 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ERG29	YMR134W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	2.96	□□□□□ -1.94	not detected
ERG29	YMR134W	ECM11	Q04110	302 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ERG29	YMR134W	SGT1	Q08446	395 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ERG29	YMR134W	RTP1	Q12751	981 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ERG29	YMR134W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ERG29	YMR134W	MRPS9	P38120	278 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ERG29	YMR134W	MDE1	P47095	244 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ERG29	YMR134W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
ERG29	YMR134W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
ERG29	YMR134W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
ERG29	YMR134W	NAM2	P11325	894 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ERG29	YMR134W	RML2	P32611	393 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ERG29	YMR134W	SPT10	P35208	640 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ERG29	YMR134W	CHK1	P38147	527 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ERG29	YMR134W	YEL057C	P39983	233 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ERG29	YMR134W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
ERG29	YMR134W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
ERG29	YMR134W	PSK1	P31374	1356 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ERG29	YMR134W	SEC66	P33754	206 aa		2.93	□□□□□ -1.94
ERG29	YMR134W	BMT2	P38278	337 aa		2.93	□□□□□ -1.94
ERG29	YMR134W	AZR1	P50080	613 aa		2.93	□□□□□ -1.94
ERG29	YMR134W	ADA2	Q02336	434 aa		2.93	□□□□□ -1.94

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