RNA–Protein interactions for RNA: YML038C

YMD8, Transcript of Putative nucleotide sugar transporter, yeast

Gene YMD8, Length 1,329 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMD8	YML038C	YAK1	P14680	807 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	SPO7	P18410	259 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	URA4	P20051	364 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	YME1	P32795	747 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	APT2	P36973	181 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	POP7	P38291	140 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	SWC5	P38326	303 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	MPS3	P47069	682 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	URB2	P47108	1174 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	MPS2	P53159	387 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	VOA1	P53262	265 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	ROT1	Q03691	256 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	SMA2	Q04658	369 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	RRG8	Q06109	277 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	VPS74	Q06385	345 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	NRT1	Q08485	598 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	SGO1	Q08490	590 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	TGS1	Q12052	315 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	MED2	Q12124	431 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	SRN2	Q99176	213 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	YBR085C-A	O43137	85 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	CDC6	P09119	513 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	SEN2	P16658	377 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	VPS34	P22543	875 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	SIP1	P32578	815 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	MTC7	P32633	139 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	TUL1	P36096	758 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	MRPL10	P36520	322 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	YBR139W	P38109	508 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	CTF8	P38877	133 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	SDP1	P40479	209 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	YNL146W	P53906	100 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	INA17	Q02888	182 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	GCN5	Q03330	439 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	YMR130W	Q04223	302 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	SPC2	Q04969	178 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	STP3	Q05937	343 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	DUS4	Q06063	367 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	TLG2	Q08144	397 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	BTS1	Q12051	335 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	PEP5	P12868	1029 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	TOD6	P34219	525 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	VPS51	P36116	164 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	CIN1	P40987	1014 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	GLG2	P47011	380 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	SPT20	P50875	604 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	COX18	P53239	316 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	YNL181W	P53878	407 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	APC4	Q04601	652 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	STE23	Q06010	1027 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	YPR078C	Q06813	372 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	FMP16	Q12497	93 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	SFG1	Q12507	346 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YMD8	YML038C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	SPE1	P08432	466 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	UTR1	P21373	530 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	APA2	P22108	325 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	CMK2	P22517	447 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	PPH22	P23595	377 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	VMA16	P23968	213 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.08	□□□□□ -1.6	not detected
YMD8	YML038C	YNL195C	P40168	261 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	PFA3	P42836	336 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	FIN1	Q03898	291 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	CAB5	Q03941	241 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	RXT3	Q07458	294 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	BSC6	Q08280	497 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	SRO7	Q12038	1033 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YMD8	YML038C	RLM1	Q12224	676 aa		5.08	□□□□□ -1.6

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