RNA–Protein interactions for RNA: YKR011C

YKR011C, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKR011C, Length 1,062 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR011C	YKR011C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	LTV1	P34078	463 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	CMC1	P36064	111 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	KRE9	P39005	276 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	CHS6	P40955	746 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	MLC1	P53141	149 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	DUG3	P53871	357 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	SHR3	Q02774	210 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	KAP120	Q02932	1032 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	MSC1	Q03104	513 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	ABZ2	Q03266	374 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	YML037C	Q03703	340 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	PPM1	Q04081	328 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	YMR087W	Q04299	284 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	GLO2	Q05584	274 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	UAF30	Q08747	228 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	GAL80	P04387	435 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	PEP5	P12868	1029 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	BUD14	P27637	709 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	NTG1	P31378	399 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	YBR144C	P34215	104 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	RRT2	P38332	387 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	CCT6	P39079	546 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	CSM2	P40465	213 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	SNG1	P46950	547 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	TWF1	P53250	332 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	AQR1	P53943	586 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	ECM18	Q04623	453 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	RRT8	Q08219	342 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	AVL9	Q12500	764 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	PUT4	P15380	627 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	CLC1	P17891	233 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	MRPL25	P23369	157 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	CPR3	P25719	182 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	ATS1	P31386	333 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	AFG1	P32317	509 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	NDC1	P32500	655 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	MRP4	P32902	394 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	RTT101	P47050	842 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	PET130	P47065	347 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	YDL186W	P48568	277 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	YGR126W	P53274	230 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	TAP42	Q04372	366 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	MSC3	Q05812	728 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	VTA1	Q06263	330 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	VPS54	Q12071	889 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	3.17	□□□□□ -1.9	not detected
YKR011C	YKR011C	YDR061W	Q12298	539 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	HIP1	P06775	603 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	SNT1	P25357	1226 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	SPC110	P32380	944 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	RML2	P32611	393 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	MRE11	P32829	692 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	YME2	P32843	850 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	PTR2	P32901	601 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	THI2	P38141	450 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	CIN4	P39110	191 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	VPS52	P39904	641 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	AFG3	P39925	761 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	HXT14	P42833	540 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	RAD17	P48581	401 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	BUD32	P53323	261 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	YNL143C	P53908	130 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	YRM1	Q12340	786 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKR011C	YKR011C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	HMX1	P32339	317 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	SEC66	P33754	206 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	HCS1	P34243	683 aa		3.15	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.7 ms