RNA–Protein interactions for RNA: YIL039W

TED1, Transcript of Conserved phosphoesterase domain-containing protein, yeast

Gene TED1, Length 1,422 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TED1	YIL039W	PIB2	P53191	635 aa		4.15	□□□□□ -1.74
TED1	YIL039W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
TED1	YIL039W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
TED1	YIL039W	RTP1	Q12751	981 aa		4.15	□□□□□ -1.74
TED1	YIL039W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.15	□□□□□ -1.74
TED1	YIL039W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	MET17	P06106	444 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	PHO2	P07269	559 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	OPI1	P21957	404 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	YCR007C	P25354	239 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	YCR022C	P25620	114 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	UTR4	P32626	227 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	MET18	P40469	1032 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	IRC6	P43615	237 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	YGL242C	P53066	181 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	MLC1	P53141	149 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	RMT2	Q03305	412 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	KRE9	P39005	276 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
TED1	YIL039W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	RTT103	Q05543	409 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	RKM5	Q12367	367 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	SET6	Q12529	373 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	ATP11	P32453	318 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	JNM1	P36224	373 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	MDM31	P38880	579 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	RPH1	P39956	796 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	RSM25	P40496	264 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	GPI1	P53306	609 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	MRPL19	P53875	158 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	SLG1	P54867	378 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	MEH1	Q02205	184 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	ATG29	Q12092	213 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	AYT1	Q12226	474 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	SEC39	Q12745	709 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	INH1	P01097	85 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	AGA1	P32323	725 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	SPC110	P32380	944 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	PMT1	P33775	817 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	SRB7	P47822	140 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	TWF1	P53250	332 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	JJJ1	P53863	590 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	HEM2	P05373	342 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	RDS1	P25611	832 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	CMC1	P36064	111 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	MRPL10	P36520	322 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	VID24	P38263	362 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	SYG1	P40528	902 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	YDL186W	P48568	277 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	GRX6	Q12438	231 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	CKA1	P15790	372 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	SWI3	P32591	825 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	SHO1	P40073	367 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	YJL213W	P40896	331 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	IRC15	Q02733	499 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	PPT2	Q12036	173 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	YPL150W	Q12152	901 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	HXT14	P42833	540 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	COS10	P52924	374 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	YGL108C	P53139	140 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	ARP5	P53946	755 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	TAF11	Q04226	346 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TED1	YIL039W	SEC66	P33754	206 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TED1	YIL039W	SMF1	P38925	575 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TED1	YIL039W	HAT2	P39984	401 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TED1	YIL039W	POP1	P41812	875 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TED1	YIL039W	EPL1	P43572	832 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TED1	YIL039W	GWT1	P47026	490 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TED1	YIL039W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TED1	YIL039W	RRD2	Q12461	358 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TED1	YIL039W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.9 ms