RNA–Protein interactions for RNA: YHR119W

SET1, Transcript of Histone methyltransferase, subunit of the COMPASS (Set1C) complex, yeast

Gene SET1, Length 3,243 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SET1	YHR119W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.89
SET1	YHR119W	ERG11	P10614	530 aa		3.21	□□□□□ -1.89
SET1	YHR119W	ALG1	P16661	449 aa		3.21	□□□□□ -1.89
SET1	YHR119W	CSM1	P25651	190 aa		3.21	□□□□□ -1.89
SET1	YHR119W	YUR1	P26725	428 aa		3.21	□□□□□ -1.89
SET1	YHR119W	PET127	P32606	800 aa		3.21	□□□□□ -1.89
SET1	YHR119W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.89
SET1	YHR119W	LNP1	P38878	278 aa		3.21	□□□□□ -1.89
SET1	YHR119W	SKN7	P38889	622 aa		3.21	□□□□□ -1.89
SET1	YHR119W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.89
SET1	YHR119W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.89
SET1	YHR119W	YGR127W	P53275	312 aa		3.21	□□□□□ -1.89
SET1	YHR119W	IRC4	Q03036	179 aa		3.21	□□□□□ -1.89
SET1	YHR119W	EKI1	Q03764	534 aa		3.21	□□□□□ -1.89
SET1	YHR119W	BCH1	Q05029	724 aa		3.21	□□□□□ -1.89
SET1	YHR119W	AKR2	Q12013	749 aa		3.21	□□□□□ -1.89
SET1	YHR119W	MED2	Q12124	431 aa		3.21	□□□□□ -1.89
SET1	YHR119W	VCX1	Q99385	411 aa		3.21	□□□□□ -1.89
SET1	YHR119W	SNT2	P53127	1403 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	BCK2	P33306	851 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	RIB1	P38066	345 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	FZO1	P38297	855 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	STB5	P38699	743 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	TRM5	P38793	499 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	ALP1	P38971	573 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	SEN34	P39707	275 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	VRG4	P40107	337 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	SDP1	P40479	209 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	IME4	P41833	600 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	ULI1	P43604	169 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	YJR149W	P47177	404 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	ECL1	P48235	211 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	RFX1	P48743	811 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	YKE2	P52553	114 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	IMO32	P53219	342 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	GIS1	Q03833	894 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	CRT10	Q08226	957 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	GLO4	Q12320	285 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	SUL2	Q12325	893 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	FUS1	P11710	512 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	ARG1	P22768	420 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	ECM25	P32525	599 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	EMP70	P32802	667 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	ECM8	P38246	354 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	PFS1	P38872	237 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	FET3	P38993	636 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	MID1	P41821	548 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	UFE1	P41834	346 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	PRM10	P42946	383 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	CTK2	P46962	323 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	IRC8	P47046	822 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	GET1	P53192	235 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	YDC1	Q02896	317 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	YMR209C	Q03648	457 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	YDR248C	Q03786	193 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	UBX2	Q04228	584 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	YPS7	Q06325	596 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	CDA2	Q06703	312 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	SYO1	Q07395	620 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	NSE1	Q07913	336 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	PET20	Q99373	253 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	YPS1	P32329	569 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	IML3	P38265	245 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	MSS4	P38994	779 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	CCT6	P39079	546 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	YJL193W	P39542	402 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	YKE4	P40544	346 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	GSM1	P42950	618 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	SBH2	P52871	88 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	ARO80	Q04052	950 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	THI3	Q07471	609 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	YOR365C	Q08844	703 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	YPL260W	Q08977	551 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	YOR223W	Q12015	292 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	YOR022C	Q12204	715 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	SNF8	Q12483	233 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	HTB2	P02294	131 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	SIR3	P06701	978 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SET1	YHR119W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9

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