RNA–Protein interactions for RNA: YFL039C

ACT1, Transcript of Actin, yeast

Gene ACT1, Length 1,128 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ACT1	YFL039C	VTA1	Q06263	330 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	TPO3	Q06451	622 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	TLG2	Q08144	397 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	YAK1	P14680	807 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	SPE2	P21182	396 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	CYM1	P32898	989 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	CMC1	P36064	111 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	MAL32	P38158	584 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	SLM4	P38247	162 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	YHR045W	P38775	560 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	TIM21	P53220	239 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	YGR117C	P53270	476 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	MAL12	P53341	584 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	GPN3	Q06543	272 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	YLL007C	Q07799	665 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	AEP3	Q12089	606 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	HIP1	P06775	603 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	SEC63	P14906	663 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	UGA1	P17649	471 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	UTR1	P21373	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	PTP1	P25044	335 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	SNT1	P25357	1226 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	YCL068C	P25593	260 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	ALY1	P36117	915 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	PHM8	P40025	321 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	ALG5	P40350	334 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	DOT5	P40553	215 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	CIN1	P40987	1014 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	SNZ3	P43545	298 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	BRO1	P48582	844 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	LIF1	P53150	421 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	SNZ2	P53824	298 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	PDR8	Q06149	701 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	VPS74	Q06385	345 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	ATG17	Q06410	417 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	VAM6	Q07468	1049 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	SRO7	Q12038	1033 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	YPT6	Q99260	215 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	RAD7	P06779	565 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	LAC1	P28496	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	RAD14	P28519	371 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	GSH1	P32477	678 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	YME2	P32843	850 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	MRPL10	P36520	322 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	MLH1	P38920	769 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	RCY1	P39531	840 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	BNA6	P43619	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	IRC7	P43623	340 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	ECM27	P47144	725 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	YGL114W	P53134	725 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	TWF1	P53250	332 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	RTT102	P53330	157 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	SLT2	Q00772	484 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	YDR239C	Q03780	787 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	URH1	Q04179	340 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	NDL1	Q06568	189 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	ERG8	P24521	451 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	PTC6	P25646	442 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	SEC66	P33754	206 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	HCS1	P34243	683 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	THI2	P38141	450 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	MAL33	P38157	468 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	RTT107	P38850	1070 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ACT1	YFL039C	ERV46	P39727	415 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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