RNA–Protein interactions for RNA: YAL067C

SEO1, Transcript of Putative permease, yeast

Gene SEO1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SEO1	YAL067C	QDR3	P38227	689 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	YHR177W	P38867	453 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	END3	P39013	349 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	ARG2	P40360	574 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	NDC80	P40460	691 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	INA22	P40576	216 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	PIB2	P53191	635 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	AAT1	Q01802	451 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	RNT1	Q02555	471 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	PFA5	Q03289	374 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	CAB5	Q03941	241 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	SOR2	Q07786	357 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	SUT2	Q12286	268 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	ERG11	P10614	530 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	MGR1	P25573	417 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	ATP11	P32453	318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	DOA4	P32571	926 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	MSN2	P33748	704 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	YBL028C	P38202	106 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	RRN10	P38204	145 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	SPC97	P38863	823 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	GAT2	P40209	560 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	KEL2	P50090	882 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	MNT4	P53745	580 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	ATC1	Q04005	294 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	RRG8	Q06109	277 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	YLL007C	Q07799	665 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	NSE1	Q07913	336 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
SEO1	YAL067C	MSN4	P33749	630 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	STP2	P38704	541 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	UBA4	P38820	440 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	SYG1	P40528	902 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	YPS6	P40583	537 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	SAS2	P40963	338 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	ECL1	P48235	211 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	YGL114W	P53134	725 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	CPR8	P53728	308 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	ATG26	Q06321	1198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	YPR078C	Q06813	372 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	THI3	Q07471	609 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	HSL1	P34244	1518 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SEO1	YAL067C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	GPA1	P08539	472 aa		4.53	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	HXT2	P23585	541 aa		4.53	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	BNA4	P38169	460 aa		4.53	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	YHR122W	P38829	231 aa		4.53	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	SPG5	P42933	373 aa		4.53	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	SNG1	P46950	547 aa		4.53	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	PHO86	P46956	311 aa		4.53	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	YHC3	P47040	408 aa		4.53	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	YLR173W	Q06247	608 aa		4.53	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	RUP1	Q12242	671 aa		4.53	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	MER1	P16523	270 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	NUP1	P20676	1076 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	ECM25	P32525	599 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	KKQ8	P36004	724 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	PET100	P38958	111 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	ERV46	P39727	415 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	ATM1	P40416	690 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	BIO3	P50277	480 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	INP2	Q03824	705 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	RDR1	Q08904	546 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	PRB1	P09232	635 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	RSR1	P13856	272 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	CDC42	P19073	191 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	PMA2	P19657	947 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	MAK32	P23060	363 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	GID7	P25569	745 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SEO1	YAL067C	FRE1	P32791	686 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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