RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641923.1

SAMMSON-223, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, human

Gene SAMMSON, Length 1,213 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SAMMSON-223	ENST00000641923	COL20A1	Q9P218	1284 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	TCHH	Q07283	1943 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	MEIS1	O00470	390 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	COBL	O75128	1261 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	CYP2B6	P20813	491 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	MRE11	P49959	708 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	MTMR1	Q13613	665 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	NEDD9	Q14511	834 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	TTLL4	Q14679	1199 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	ANO1	Q5XXA6	986 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	FERMT2	Q96AC1	680 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	JADE2	Q9NQC1	790 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	TRIM17	Q9Y577	477 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	NFASC	O94856	1347 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	SLC26A4	O43511	780 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	ADCY3	O60266	1144 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	MSC	O60682	206 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	PPP6R2	O75170	966 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	UBXN2A	P68543	259 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	PRKCZ	Q05513	592 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	STK38	Q15208	465 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	CALCRL	Q16602	461 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	PRR16	Q569H4	304 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	RIT2	Q99578	217 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923		Q9Y3F1	56 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SAMMSON-223	ENST00000641923	ELP1	O95163	1332 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	DTNB	O60941	627 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	OR52Z1	P0C646	297 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	CTGF	P29279	349 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	GRK4	P32298	578 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	ACVR2B	Q13705	512 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	PKP1	Q13835	747 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	PDIA5	Q14554	519 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	SLC39A14	Q15043	492 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	RDM1	Q8NG50	284 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	ERMN	Q8TAM6	284 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	PGBD1	Q96JS3	809 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	SPATA32	Q96LK8	384 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	FGD4	Q96M96	766 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	AK8	Q96MA6	479 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	SDF4	Q9BRK5	362 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	ASTN1	O14525	1302 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	FAM86B1	E9PN63	330 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	FOXN1	O15353	648 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	10.13	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	GAS7	O60861	476 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	IGHA2	P01877	340 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	AKR1A1	P14550	325 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	ITGB5	P18084	799 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	MCM7	P33993	719 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	KRT76	Q01546	638 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	PTGDR	Q13258	359 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	NEK9	Q8TD19	979 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SAMMSON-223	ENST00000641923	SPOCK2	Q92563	424 aa		10.13	□□□□□ -0.79

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