RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638075.1

EFHC1-238, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 4

Gene EFHC1, Length 540 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-238	ENST00000638075	IQCF3	P0C7M6	154 aa		11.72	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	ICAM3	P32942	547 aa		11.72	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	PBX2	P40425	430 aa		11.72	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	BFSP2	Q13515	415 aa		11.72	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	PTGIS	Q16647	500 aa		11.72	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		11.72	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		11.72	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	KCNB2	Q92953	911 aa		11.72	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	TIFA	Q96CG3	184 aa		11.72	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		11.72	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	SPATA33	Q96N06	139 aa		11.72	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	ZNF576	Q9H609	170 aa		11.72	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		11.72	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	MYO9B	Q13459	2157 aa		11.72	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	TET1	Q8NFU7	2136 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	RFC2	P35250	354 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	PSEN2	P49810	448 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	CHMP4BP1	P59074	171 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	SEMA3F	Q13275	785 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	KRT32	Q14532	448 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	MFSD10	Q14728	455 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	GRIN2C	Q14957	1233 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	APOA5	Q6Q788	366 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	RETREG2	Q8NC44	543 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	MYLIP	Q8WY64	445 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	CUL5	Q93034	780 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	REV3L	O60673	3130 aa		11.71	□□□□□ -0.53
EFHC1-238	ENST00000638075	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	SORBS3	O60504	671 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	ZNF286B	P0CG31	522 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	RBL2	Q08999	1139 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	FUT2	Q10981	343 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	NEDD9	Q14511	834 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	GPNMB	Q14956	572 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	MICU3	Q86XE3	530 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	C7orf31	Q8N865	590 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	CAGE1	Q8TC20	777 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	ALG1	Q9BT22	464 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	NOD1	Q9Y239	953 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	GBF1	Q92538	1859 aa		11.7	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	FIBP	O43427	364 aa		11.69	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	HSPA4	P34932	840 aa		11.69	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	PTK7	Q13308	1070 aa		11.69	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	HIC1	Q14526	733 aa		11.69	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	RAB30	Q15771	203 aa		11.69	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	METTL7B	Q6UX53	244 aa		11.69	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		11.69	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		11.69	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	MSRA	Q9UJ68	235 aa		11.69	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		11.68	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		11.68	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075		H3BRB1	525 aa		11.68	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	ZBTB43	O43298	467 aa		11.68	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	CKB	P12277	381 aa		11.68	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	ACTN1	P12814	892 aa		11.68	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	SELP	P16109	830 aa		11.68	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	ITGB5	P18084	799 aa		11.68	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	HOXC8	P31273	242 aa		11.68	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	RCAN1	P53805	252 aa		11.68	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		11.68	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		11.68	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	GPR20	Q99678	358 aa		11.68	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	USP26	Q9BXU7	913 aa		11.68	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
EFHC1-238	ENST00000638075	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		11.68	□□□□□ -0.54

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