RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		6.14	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCA6	Q8N139	1617 aa		6.14	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	6.14	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		6.14	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	AGRP	O00253	132 aa		6.14	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	PIP5K1C	O60331	668 aa		6.14	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	BPI	P17213	487 aa		6.14	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC7A5	Q01650	507 aa		6.14	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	CYP27A1	Q02318	531 aa		6.14	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	GALE	Q14376	348 aa		6.14	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	PTPN21	Q16825	1174 aa		6.14	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		6.14	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	ANO1	Q5XXA6	986 aa		6.14	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		6.14	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		6.14	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	BRAP	Q7Z569	592 aa		6.14	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		6.14	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	NBPF11	Q86T75	865 aa		6.14	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	6.14	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	6.14	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		6.14	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		6.14	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	JADE2	Q9NQC1	790 aa		6.14	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	ATG3	Q9NT62	314 aa		6.14	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF69	Q9UC07	566 aa		6.14	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	TNFRSF10C	O14798	259 aa		6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	EOMES	O95936	686 aa		6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	SRGN	P10124	158 aa		6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	PTMS	P20962	102 aa		6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP2R2A	P63151	447 aa		6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	GBX1	Q14549	363 aa		6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	GRM3	Q14832	879 aa		6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	SV2C	Q496J9	727 aa		6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	IFT22	Q9H7X7	185 aa		6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	RGS13	O14921	159 aa		6.12	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	PHKG2	P15735	406 aa		6.12	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	RAG1	P15918	1043 aa		6.12	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	HAL	P42357	657 aa		6.12	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	GRB10	Q13322	594 aa		6.12	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		6.12	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		6.12	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	CDH24	Q86UP0	819 aa		6.12	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	TEX19	Q8NA77	164 aa		6.12	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		6.12	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		6.12	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		6.12	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		6.12	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		6.12	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		6.12	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	PRR19	A6NJB7	356 aa		6.11	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	FZD9	O00144	591 aa		6.11	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC26A4	O43511	780 aa		6.11	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	PRKD3	O94806	890 aa		6.11	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	CAPNS1	P04632	268 aa		6.11	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	LDHC	P07864	332 aa		6.11	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	FGFR1	P11362	822 aa		6.11	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	ITGB7	P26010	798 aa		6.11	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	GRIA2	P42262	883 aa		6.11	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	6.11	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	6.11	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF280D	Q6N043	979 aa		6.11	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	CPXCR1	Q8N123	301 aa		6.11	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		6.11	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	USP7	Q93009	1102 aa		6.11	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	OSBP2	Q969R2	916 aa		6.11	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		6.11	□□□□□ -1.43
EFHC1-223	ENST00000636616	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		6.11	□□□□□ -1.43

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