RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAF7Q6Q0C0 670 aa31.9■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPRSQ13332 1948 aa31.9■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 HAS3O00219 553 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 THPOP40225 353 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 MBTPS1Q14703 1052 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 TICAM2Q86XR7 235 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 GJD3Q8N144 294 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA33Q96N06 139 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 EMSYQ7Z589 1322 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-217ENST00000629983 DBF4BQ8NFT6 615 aa31.88■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP31.88■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 JMJD4Q9H9V9 463 aa31.88■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 B4E1Z4 1266 aa31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM178BQ8IXR5 827 aa31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 RSPH10B2B2RC85 870 aa31.86■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 GGPS1O95749 300 aa31.86■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 RSPH10BP0C881 870 aa31.86■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 IL9P15248 144 aa31.86■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPROQ16827 1216 aa31.86■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 CTNNA3Q9UI47 895 aa31.86■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 NT5C2P49902 561 aa31.85■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 EP400NLQ6ZTU2 488 aa31.85■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 UIMC1Q96RL1 719 aa31.85■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 AMNQ9BXJ7 453 aa31.85■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 PPFIA4O75335 1185 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 HSDL1Q3SXM5 330 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNV1Q6PIU1 500 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
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CAPNS1-217ENST00000629983 YME1L1Q96TA2 773 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 PDCD2LQ9BRP1 358 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 C17orf102A2RUQ5 167 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 SDSP20132 328 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 HSD17B4P51659 736 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 HIC1Q14526 733 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 MYSM1Q5VVJ2 828 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 SERINC5Q86VE9 423 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKS1AQ92625 1134 aa31.83■■■□□ 2.69
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CAPNS1-217ENST00000629983 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
CAPNS1-217ENST00000629983 TIGD5Q53EQ6 642 aa31.82■■■□□ 2.68
CAPNS1-217ENST00000629983 UBAC1Q9BSL1 405 aa31.82■■■□□ 2.68
CAPNS1-217ENST00000629983 MLXIPQ9HAP2 919 aa31.82■■■□□ 2.68
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR33A8MZF0 331 aa31.81■■■□□ 2.68
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CAPNS1-217ENST00000629983 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP31.8■■■□□ 2.68
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CAPNS1-217ENST00000629983 GPM6BQ13491 265 aa31.79■■■□□ 2.68
CAPNS1-217ENST00000629983 PGM5Q15124 567 aa31.79■■■□□ 2.68
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CAPNS1-217ENST00000629983 SIP14410 1827 aa31.78■■■□□ 2.68
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CAPNS1-217ENST00000629983 CCND2P30279 289 aa31.78■■■□□ 2.68
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CAPNS1-217ENST00000629983 KRT23Q9C075 422 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa31.77■■■□□ 2.68
CAPNS1-217ENST00000629983 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa31.77■■■□□ 2.68
CAPNS1-217ENST00000629983 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa31.77■■■□□ 2.68
CAPNS1-217ENST00000629983 RRP1P56182 461 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
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CAPNS1-217ENST00000629983 KLRF2D3W0D1 207 aa31.76■■■□□ 2.67
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CAPNS1-217ENST00000629983 NOP56O00567 594 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB5O15062 677 aa31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 TREHO43280 583 aa31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 SP2Q02086 613 aa31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-217ENST00000629983 TCEAL5Q5H9L2 206 aa31.76■■■□□ 2.67
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