RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 SHCBP1Q8NEM2 672 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-215ENST00000628018 DNERQ8NFT8 737 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-215ENST00000628018 CALML4Q96GE6 196 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-215ENST00000628018 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa28.02■■■□□ 2.08
CAPNS1-215ENST00000628018 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMD10O75832 226 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC10A3P09131 477 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 PLCG1P19174 1290 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 CCND2P30279 289 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 SNX29Q8TEQ0 813 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 NUDT12Q9BQG2 462 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR11Q9BZH6 1224 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 MROH8Q9H579 483 aa28.01■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC26A4O43511 780 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 PRR29P0C7W0 189 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 GRB10Q13322 594 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC15Q8TF66 581 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 PNMA5Q96PV4 448 aa28■■■□□ 2.07
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF577Q9BSK1 485 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 CUEDC2Q9H467 287 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 GRPEL1Q9HAV7 217 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNH7Q9NS40 1196 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 MORF4L1Q9UBU8 362 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa28■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 TOMM70O94826 608 aa27.99■■■□□ 2.07
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CAPNS1-215ENST00000628018 PLIN2Q99541 437 aa27.99■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 AFMP43652 599 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 MRE11P49959 708 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 CNTN2Q02246 1040 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 STX1AQ16623 288 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 HYIQ5T013 277 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 NT5DC1Q5TFE4 455 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 OTOP1Q7RTM1 612 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 SPATA20Q8TB22 786 aa27.98■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 IWS1Q96ST2 819 aa27.98■■■□□ 2.07
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CAPNS1-215ENST00000628018 SARSP49591 514 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP2R5CQ13362 524 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 MTMR1Q13613 665 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM119Q4V9L6 283 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM133AQ8N9E0 248 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 RIT2Q99578 217 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 MAGEF1Q9HAY2 307 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 STK24Q9Y6E0 443 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ASTN1O14525 1302 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 POTEB2H3BUK9 544 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 STAM2O75886 525 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 CCNA1P78396 465 aa27.97■■■□□ 2.07
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CAPNS1-215ENST00000628018 NCAPH2Q6IBW4 605 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 PORCNQ9H237 461 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 KBTBD4Q9NVX7 518 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ANO10Q9NW15 660 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 STK17AQ9UEE5 414 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa27.97■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM88BA6NKF7 163 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 GAS7O60861 476 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 DPYDQ12882 1025 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 B3GNT9Q6UX72 402 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 STAMQ92783 540 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC102AQ96A19 550 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 HHIPL1Q96JK4 782 aa27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A087WWV3 80 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 SOWAHBA6NEL2 793 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP27.95■■■□□ 2.065e-7■■■■□ 22.6
CAPNS1-215ENST00000628018 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 NLRP12P59046 1061 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 ECM1Q16610 540 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 HAUS3Q68CZ6 603 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 ERMNQ8TAM6 284 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 SMARCE1Q969G3 411 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 GPRASP2Q96D09 838 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 MMP19Q99542 508 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 TEKT3Q9BXF9 490 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 NT5C3AQ9H0P0 336 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 MAFGO15525 162 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 DHX15O43143 795 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 INHBEP58166 350 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 KCTD2Q14681 263 aa27.94■■■□□ 2.06
CAPNS1-215ENST00000628018 EFCC1Q9HA90 598 aa27.94■■■□□ 2.06
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