RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608473.5

GTF3C2-AS1-211, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTF3C2-AS1, Length 554 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RMDN3Q96TC7 470 aa10.05□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SLC24A3Q9HC58 644 aa10.05□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PRDM6Q9NQX0 595 aa10.05□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 B4E1Z4 1266 aa10.04□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PARNO95453 639 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CFBP00751 764 aa10.04□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IQCF3P0C7M6 154 aa10.04□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TRDNQ13061 729 aa10.04□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HIC1Q14526 733 aa10.04□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DGKDQ16760 1214 aa10.04□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 C7orf31Q8N865 590 aa10.04□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CAGE1Q8TC20 777 aa10.04□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 AFG1LQ8WV93 481 aa10.04□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TAAR1Q96RJ0 339 aa10.04□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZBED2Q9BTP6 218 aa10.04□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KATNAL1Q9BW62 490 aa10.04□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 AMNQ9BXJ7 453 aa10.04□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CPVLQ9H3G5 476 aa10.04□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MRVI1Q9Y6F6 885 aa10.04□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NEDD4P46934 1319 aa10.04□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ERICH2A1L162 156 aa10.03□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 BAIAP3O94812 1187 aa10.03□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CA3P07451 260 aa10.03□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MYOGP15173 224 aa10.03□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FECHP22830 423 aa10.03□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NUCB1Q02818 461 aa10.03□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LAMC2Q13753 1193 aa10.03□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ADGRE1Q14246 886 aa10.03□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LY6KQ17RY6 165 aa10.03□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 QRICH1Q2TAL8 776 aa10.03□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa10.03□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SMC5Q8IY18 1101 aa10.03□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 AFAP1L1Q8TED9 768 aa10.03□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ANKS1AQ92625 1134 aa10.03□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KCNK17Q96T54 332 aa10.03□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DSCC1Q9BVC3 393 aa10.03□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 OSBPL3Q9H4L5 887 aa10.03□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZSWIM5Q9P217 1185 aa10.03□□□□□ -0.8
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TLL1O43897 1013 aa10.02□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NR3C2P08235 984 aa10.02□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MMP3P08254 477 aa10.02□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SELPP16109 830 aa10.02□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KCNV1Q6PIU1 500 aa10.02□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HERC6Q8IVU3 1022 aa10.02□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa10.02□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa10.02□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RUFY2Q8WXA3 655 aa10.02□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TBC1D5Q92609 795 aa10.02□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HS3ST6Q96QI5 342 aa10.02□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ALG1Q9BT22 464 aa10.02□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CERS4Q9HA82 394 aa10.02□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KLRF2D3W0D1 207 aa10.01□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ARIH2O95376 493 aa10.01□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 COL9A1P20849 921 aa10.01□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PSEN2P49810 448 aa10.01□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SART3Q15020 963 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CCDC62Q6P9F0 684 aa10.01□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LRRC8DQ7L1W4 858 aa10.01□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SAMD3Q8N6K7 520 aa10.01□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ARNTL2Q8WYA1 636 aa10.01□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 JMJD4Q9H9V9 463 aa10.01□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa10.01□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZBTB5O15062 677 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 EFCAB14O75071 495 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PPFIA4O75335 1185 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ARHGAP1Q07960 439 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IKBKEQ14164 716 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KIAA0753Q2KHM9 967 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CNKSR3Q6P9H4 555 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SESTD1Q86VW0 696 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HOMER1Q86YM7 354 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PPTC7Q8NI37 304 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SPATA33Q96N06 139 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MLXIPQ9HAP2 919 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PXMP2Q9NR77 195 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 COG5Q9UP83 839 aa10□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RFXAPO00287 272 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NOP56O00567 594 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IGHDP01880 384 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 POLR2MP0CAP2 368 aa9.99□□□□□ -0.81
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CCND2P30279 289 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms