RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594708.1

SMC5-AS1-201, Transcript of SMC5 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMC5-AS1, Length 1,818 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GPRASP2Q96D09 838 aa22.21■■□□□ 1.15
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.21■■□□□ 1.15
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.21■■□□□ 1.15
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.2■■□□□ 1.15
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FIBPO43427 364 aa22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MCM7P33993 719 aa22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TRAPPC10P48553 1259 aa22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF174Q15697 407 aa22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LY6KQ17RY6 165 aa22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TTC38Q5R3I4 469 aa22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MOXD1Q6UVY6 613 aa22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SCFD2Q8WU76 684 aa22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MBOAT7Q96N66 472 aa22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ATP9AO75110 1047 aa22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SMPD1P17405 629 aa22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ICAM3P32942 547 aa22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 Q4G0T1 1027 aa22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.2■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SEPT4O43236 478 aa22.19■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TNFAIP2Q03169 654 aa22.19■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TTLL4Q14679 1199 aa22.19■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.19■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 COPS5Q92905 334 aa22.19■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GJA10Q969M2 543 aa22.19■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ARMC5Q96C12 935 aa22.19■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF333Q96JL9 665 aa22.19■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.19■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.19■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SORBS3O60504 671 aa22.18■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 AKR1A1P14550 325 aa22.18■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NUCB2P80303 420 aa22.18■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 POTEDQ86YR6 584 aa22.18■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MSH4O15457 936 aa22.17■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MAFGO15525 162 aa22.17■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TGFB3P10600 412 aa22.17■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CCL5P13501 91 aa22.17■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KCNA2P16389 499 aa22.17■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.17■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.17■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CDHR1Q96JP9 859 aa22.17■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.17■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.17■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RNF208Q9H0X6 261 aa22.16■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NEMFO60524 1076 aa22.15■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.15■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.15■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HAS1Q92839 578 aa22.15■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KCNMB3Q9NPA1 279 aa22.15■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CLIC4Q9Y696 253 aa22.15■■□□□ 1.14
SMC5-AS1-201ENST00000594708 POTEFA5A3E0 1075 aa22.14■■□□□ 1.13
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GGPS1O95749 300 aa22.14■■□□□ 1.13
SMC5-AS1-201ENST00000594708 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CALCRLQ16602 461 aa22.14■■□□□ 1.13
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.14■■□□□ 1.13
SMC5-AS1-201ENST00000594708 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.14■■□□□ 1.13
SMC5-AS1-201ENST00000594708 USP28Q96RU2 1077 aa22.14■■□□□ 1.13
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.14■■□□□ 1.13
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.14■■□□□ 1.13
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.14■■□□□ 1.13
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RARBP10826 455 aa22.13■■□□□ 1.13
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PTGDRQ13258 359 aa22.13■■□□□ 1.13
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LHX8Q68G74 356 aa22.13■■□□□ 1.13
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SLC5A5Q92911 643 aa22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms