RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589931.1

TXNL1-210, Transcript of thioredoxin like 1, humanhuman

TSL 3

Gene TXNL1, Length 466 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNL1-210ENST00000589931 CDIP1Q9H305 208 aa5.48□□□□□ -1.53
TXNL1-210ENST00000589931 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa5.48□□□□□ -1.53
TXNL1-210ENST00000589931 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
TXNL1-210ENST00000589931 KRIT1O00522 736 aa5.47□□□□□ -1.53
TXNL1-210ENST00000589931 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
TXNL1-210ENST00000589931 MSCO60682 206 aa5.47□□□□□ -1.53
TXNL1-210ENST00000589931 TADA3O75528 432 aa5.47□□□□□ -1.53
TXNL1-210ENST00000589931 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
TXNL1-210ENST00000589931 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
TXNL1-210ENST00000589931 RBL2Q08999 1139 aa5.47□□□□□ -1.53
TXNL1-210ENST00000589931 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
TXNL1-210ENST00000589931 NTRK3Q16288 839 aa5.47□□□□□ -1.53
TXNL1-210ENST00000589931 KIZQ2M2Z5 673 aa5.47□□□□□ -1.53
TXNL1-210ENST00000589931 STYK1Q6J9G0 422 aa5.47□□□□□ -1.53
TXNL1-210ENST00000589931 LBX2Q6XYB7 198 aa5.47□□□□□ -1.53
TXNL1-210ENST00000589931 TTLL7Q6ZT98 887 aa5.47□□□□□ -1.53
TXNL1-210ENST00000589931 SCUBE1Q8IWY4 988 aa5.47□□□□□ -1.53
TXNL1-210ENST00000589931 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa5.47□□□□□ -1.53
TXNL1-210ENST00000589931 FAM26EQ8N5C1 309 aa5.47□□□□□ -1.53
TXNL1-210ENST00000589931 SYT8Q8NBV8 401 aa5.47□□□□□ -1.53
TXNL1-210ENST00000589931 FEZF2Q8TBJ5 459 aa5.47□□□□□ -1.53
TXNL1-210ENST00000589931 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa5.47□□□□□ -1.53
TXNL1-210ENST00000589931 C20orf173Q96LM9 149 aa5.47□□□□□ -1.53
TXNL1-210ENST00000589931 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
TXNL1-210ENST00000589931 CDC6Q99741 560 aa5.47□□□□□ -1.53
TXNL1-210ENST00000589931 GORASP1Q9BQQ3 440 aa5.47□□□□□ -1.53
TXNL1-210ENST00000589931 NTMQ9P121 344 aa5.47□□□□□ -1.53
TXNL1-210ENST00000589931 PFDN2Q9UHV9 154 aa5.47□□□□□ -1.53
TXNL1-210ENST00000589931 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 A0A1B0GTL3 188 aa5.46□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 TCRBV5S2A0A599 114 aa5.46□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 BLACEA4D250 179 aa5.46□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 ADCY3O60266 1144 aa5.46□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 GRK2P25098 689 aa5.46□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 GRK3P35626 688 aa5.46□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 STAT5AP42229 794 aa5.46□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 GPR85P60893 370 aa5.46□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 NKX3-2P78367 333 aa5.46□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 SERINC3Q13530 473 aa5.46□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 SOGA3Q5TF21 947 aa5.46□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 KCNT2Q6UVM3 1135 aa5.46□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 IFNL3Q8IZI9 196 aa5.46□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 CARFQ8N187 725 aa5.46□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 KYQ8NBH2 561 aa5.46□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 ARRDC4Q8NCT1 418 aa5.46□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP5.46□□□□□ -1.549e-43■■■■■ 29.9
TXNL1-210ENST00000589931 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 JAM3Q9BX67 310 aa5.46□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 SMOC1Q9H4F8 434 aa5.46□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 RTEL1Q9NZ71 1219 aa5.46□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 MYOTQ9UBF9 498 aa5.46□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 SARSP49591 514 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 NFIXQ14938 502 aa5.45□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 CR1LQ2VPA4 569 aa5.45□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 CYP4F22Q6NT55 531 aa5.45□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 LRP10Q7Z4F1 713 aa5.45□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 TRIM48Q8IWZ4 208 aa5.45□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa5.45□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 TTLL6Q8N841 843 aa5.45□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 SPATA25Q9BR10 227 aa5.45□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 ALG1Q9BT22 464 aa5.45□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 SLC6A20Q9NP91 592 aa5.45□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 DTLQ9NZJ0 730 aa5.45□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa5.44□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 SOD2P04179 222 aa5.44□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 GNAT1P11488 350 aa5.44□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 THBS2P35442 1172 aa5.44□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 ITGA1P56199 1179 aa5.44□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 SPIRE1Q08AE8 756 aa5.44□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 RASA3Q14644 834 aa5.44□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 OTOP3Q7RTS5 596 aa5.44□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 FRMD5Q7Z6J6 570 aa5.44□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa5.44□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 RELTQ969Z4 430 aa5.44□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 DEPDC7Q96QD5 511 aa5.44□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 SYT3Q9BQG1 590 aa5.44□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 USP40Q9NVE5 1235 aa5.44□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 NUB1Q9Y5A7 615 aa5.44□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa5.43□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 RPL13P26373 211 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 GJA9P57773 515 aa5.43□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 LONRF2Q1L5Z9 754 aa5.43□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 FAM209AQ5JX71 171 aa5.43□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 NT5DC1Q5TFE4 455 aa5.43□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 TEPPQ6URK8 271 aa5.43□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 STK32CQ86UX6 486 aa5.43□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 TEPSINQ96N21 525 aa5.43□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 KCNJ15Q99712 375 aa5.43□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 SNTG2Q9NY99 539 aa5.43□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 ASH2LQ9UBL3 628 aa5.43□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 KDM2BQ8NHM5 1336 aa5.43□□□□□ -1.54
TXNL1-210ENST00000589931 ASXL2Q76L83 1435 aa5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms