RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 PLCG1P19174 1290 aa29.3■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 STAT6P42226 847 aa29.3■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 GRB10Q13322 594 aa29.3■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 MTRQ99707 1265 aa29.3■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 ASTN1O14525 1302 aa29.29■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 NR3C2P08235 984 aa29.29■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 KRT79Q5XKE5 535 aa29.29■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 RASSF8Q8NHQ8 419 aa29.29■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 SNX29Q8TEQ0 813 aa29.29■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 PNMA5Q96PV4 448 aa29.29■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 WDR11Q9BZH6 1224 aa29.29■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 GRPEL1Q9HAV7 217 aa29.29■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 JADE2Q9NQC1 790 aa29.29■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC10A3P09131 477 aa29.29■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC34Q96HJ3 373 aa29.29■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 PLIN2Q99541 437 aa29.29■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 KCNH7Q9NS40 1196 aa29.29■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa29.29■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 CCND2P30279 289 aa29.28■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 CNTN2Q02246 1040 aa29.28■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 NT5DC1Q5TFE4 455 aa29.28■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 SHCBP1Q8NEM2 672 aa29.28■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 DNERQ8NFT8 737 aa29.28■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 SPATA20Q8TB22 786 aa29.28■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 CALML4Q96GE6 196 aa29.28■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF577Q9BSK1 485 aa29.28■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 A0A087WWV3 80 aa29.27■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 AFMP43652 599 aa29.27■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 HYIQ5T013 277 aa29.27■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 CUEDC2Q9H467 287 aa29.27■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 MROH8Q9H579 483 aa29.27■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 MORF4L1Q9UBU8 362 aa29.27■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 STX1AQ16623 288 aa29.26■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM119Q4V9L6 283 aa29.26■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 LRCH2Q5VUJ6 765 aa29.26■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 OTOP1Q7RTM1 612 aa29.26■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa29.26■■■□□ 2.28
SCAMP4-210ENST00000588555 SARSP49591 514 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 MRE11P49959 708 aa29.26■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 ECM1Q16610 540 aa29.26■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 ANO6Q4KMQ2 910 aa29.26■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 B3GNT9Q6UX72 402 aa29.26■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM133AQ8N9E0 248 aa29.26■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 PORCNQ9H237 461 aa29.26■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 KBTBD4Q9NVX7 518 aa29.26■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC26A4O43511 780 aa29.25■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 DPYDQ12882 1025 aa29.25■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 PPP2R5CQ13362 524 aa29.25■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 MTMR1Q13613 665 aa29.25■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa29.25■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 STAMQ92783 540 aa29.25■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 IWS1Q96ST2 819 aa29.25■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 RIT2Q99578 217 aa29.25■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP29.24■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 TOMM70O94826 608 aa29.24■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 NCAPH2Q6IBW4 605 aa29.24■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 RNF214Q8ND24 703 aa29.24■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 MAGEF1Q9HAY2 307 aa29.24■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 POTEB2H3BUK9 544 aa29.24■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 BIN1O00499 593 aa29.24■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 GAS7O60861 476 aa29.24■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 CASP1P29466 404 aa29.24■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 DNAJC25Q9H1X3 360 aa29.24■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa29.24■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 ANO10Q9NW15 660 aa29.24■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 STK17AQ9UEE5 414 aa29.24■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa29.23■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa29.23■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 SOWAHBA6NEL2 793 aa29.23■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 EML1O00423 815 aa29.23■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 DHX15O43143 795 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 RGS20O76081 388 aa29.23■■■□□ 2.27
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SCAMP4-210ENST00000588555 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 EFCC1Q9HA90 598 aa29.23■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM88BA6NKF7 163 aa29.22■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 MED24O75448 989 aa29.22■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 STAM2O75886 525 aa29.22■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 NLRP12P59046 1061 aa29.22■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 CCNA1P78396 465 aa29.22■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 HAUS3Q68CZ6 603 aa29.22■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 SMARCE1Q969G3 411 aa29.22■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 GPRASP2Q96D09 838 aa29.22■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa29.22■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 EDNRBP24530 442 aa29.21■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
SCAMP4-210ENST00000588555 KCNK18Q7Z418 384 aa29.21■■■□□ 2.27
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