RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587465.6

TNNT1-208, Transcript of troponin T1, slow skeletal type, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNNT1, Length 1,065 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1-208ENST00000587465 NOD1Q9Y239 953 aa22.48■■□□□ 1.19
TNNT1-208ENST00000587465 PITPNM1O00562 1244 aa22.47■■□□□ 1.19
TNNT1-208ENST00000587465 F2P00734 622 aa22.47■■□□□ 1.19
TNNT1-208ENST00000587465 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TNNT1-208ENST00000587465 MFSD10Q14728 455 aa22.47■■□□□ 1.19
TNNT1-208ENST00000587465 NECTIN1Q15223 517 aa22.47■■□□□ 1.19
TNNT1-208ENST00000587465 RAB30Q15771 203 aa22.47■■□□□ 1.19
TNNT1-208ENST00000587465 DGKDQ16760 1214 aa22.47■■□□□ 1.19
TNNT1-208ENST00000587465 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.47■■□□□ 1.19
TNNT1-208ENST00000587465 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TNNT1-208ENST00000587465 SESTD1Q86VW0 696 aa22.47■■□□□ 1.19
TNNT1-208ENST00000587465 PPTC7Q8NI37 304 aa22.47■■□□□ 1.19
TNNT1-208ENST00000587465 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.47■■□□□ 1.19
TNNT1-208ENST00000587465 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.47■■□□□ 1.19
TNNT1-208ENST00000587465 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TNNT1-208ENST00000587465 TTC28Q96AY4 2481 aa22.47■■□□□ 1.19
TNNT1-208ENST00000587465 DDAH1O94760 285 aa22.46■■□□□ 1.19
TNNT1-208ENST00000587465 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
TNNT1-208ENST00000587465 CCND2P30279 289 aa22.46■■□□□ 1.19
TNNT1-208ENST00000587465 LAMC2Q13753 1193 aa22.46■■□□□ 1.19
TNNT1-208ENST00000587465 SPATA33Q96N06 139 aa22.46■■□□□ 1.19
TNNT1-208ENST00000587465 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
TNNT1-208ENST00000587465 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.46■■□□□ 1.19
TNNT1-208ENST00000587465 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.46■■□□□ 1.19
TNNT1-208ENST00000587465 RFXAPO00287 272 aa22.45■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.45■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 CASC1Q6TDU7 716 aa22.45■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 RETREG2Q8NC44 543 aa22.45■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.45■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.45■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 CERS4Q9HA82 394 aa22.45■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 EPOPA6NHQ4 379 aa22.44■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 MEIS2O14770 477 aa22.44■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 NBNO60934 754 aa22.44■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 MBTPS1Q14703 1052 aa22.44■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.44■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.44■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.44■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 CA3P07451 260 aa22.43■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 PFKMP08237 780 aa22.43■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 MCM5P33992 734 aa22.43■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 BFSP2Q13515 415 aa22.43■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.43■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.43■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 TRIM50Q86XT4 487 aa22.43■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 C7orf31Q8N865 590 aa22.43■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.43■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.43■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 CKBP12277 381 aa22.42■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 SELPP16109 830 aa22.42■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 IGFBP4P22692 258 aa22.42■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 RFC2P35250 354 aa22.42■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 DEFB103AP81534 67 aa22.42■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 UBE2SQ16763 222 aa22.42■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 RASEFQ8IZ41 740 aa22.42■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 CCDC69A6NI79 296 aa22.41■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 SP4Q02446 784 aa22.41■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 RBL2Q08999 1139 aa22.41■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.41■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.41■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.41■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 MICU3Q86XE3 530 aa22.41■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.41■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 CAGE1Q8TC20 777 aa22.41■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.41■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 TMEM87BQ96K49 555 aa22.41■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 MAP3K14Q99558 947 aa22.41■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.41■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 LCHNA4D1U4 455 aa22.4■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.4■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 LGALS2P05162 132 aa22.4■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 KRT40Q6A162 431 aa22.4■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.4■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.4■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.4■■□□□ 1.18
TNNT1-208ENST00000587465 SIP14410 1827 aa22.39■■□□□ 1.17
TNNT1-208ENST00000587465 PPFIA4O75335 1185 aa22.39■■□□□ 1.17
TNNT1-208ENST00000587465 ICAM3P32942 547 aa22.39■■□□□ 1.17
TNNT1-208ENST00000587465 KIF5BP33176 963 aa22.39■■□□□ 1.17
TNNT1-208ENST00000587465 LIFRP42702 1097 aa22.39■■□□□ 1.17
TNNT1-208ENST00000587465 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
TNNT1-208ENST00000587465 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.39■■□□□ 1.17
TNNT1-208ENST00000587465 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.39■■□□□ 1.17
TNNT1-208ENST00000587465 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.39■■□□□ 1.17
TNNT1-208ENST00000587465 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.39■■□□□ 1.17
TNNT1-208ENST00000587465 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
TNNT1-208ENST00000587465 KAT6AQ92794 2004 aa22.38■■□□□ 1.17
TNNT1-208ENST00000587465 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.38■■□□□ 1.17
TNNT1-208ENST00000587465 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.38■■□□□ 1.17
TNNT1-208ENST00000587465 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.38■■□□□ 1.17
TNNT1-208ENST00000587465 ACTN1P12814 892 aa22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.9 ms