RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575514.5

EDC4-211, Transcript of enhancer of mRNA decapping 4, humanhuman

TSL 5

Gene EDC4, Length 1,016 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4-211ENST00000575514 SP2Q02086 613 aa20.38■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.38■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 C7orf31Q8N865 590 aa20.38■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 SPATA33Q96N06 139 aa20.38■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 CTAGE1Q96RT6 745 aa20.38■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.38■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 CUL9Q8IWT3 2517 aa20.37■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 SORBS3O60504 671 aa20.37■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 PPFIA4O75335 1185 aa20.37■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 RXRAP19793 462 aa20.37■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 MFSD10Q14728 455 aa20.37■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.37■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 HSDL1Q3SXM5 330 aa20.37■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 GNPTABQ3T906 1256 aa20.37■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 CAGE1Q8TC20 777 aa20.37■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 ALG1Q9BT22 464 aa20.37■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 LRRC2Q9BYS8 371 aa20.37■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.37■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 SLC12A7Q9Y666 1083 aa20.37■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 HAS3O00219 553 aa20.36■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 STAM2O75886 525 aa20.36■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 ACTN1P12814 892 aa20.36■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 RNF20Q5VTR2 975 aa20.36■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa20.36■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 AFAP1L1Q8TED9 768 aa20.36■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 CUL5Q93034 780 aa20.36■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa20.36■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 PIK3CDO00329 1044 aa20.35■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 RABGGTBP53611 331 aa20.35■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.35■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 SGMS1Q86VZ5 419 aa20.35■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.35■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.35■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 CHD7Q9P2D1 2997 aa20.34■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 MEIS2O14770 477 aa20.34■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 ICAM3P32942 547 aa20.34■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 RBL2Q08999 1139 aa20.34■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 PRDM12Q9H4Q4 367 aa20.34■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 SLC28A3Q9HAS3 691 aa20.34■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa20.34■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 TET1Q8NFU7 2136 aa20.33■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 VCANP13611 3396 aa20.33■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa20.33■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 FIBPO43427 364 aa20.33■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 CDC45O75419 566 aa20.33■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 SELPP16109 830 aa20.33■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 TMTC3Q6ZXV5 915 aa20.33■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 LRRC8DQ7L1W4 858 aa20.33■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 MICU3Q86XE3 530 aa20.33■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 FANCBQ8NB91 859 aa20.33■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 NEK1Q96PY6 1258 aa20.33■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.33■□□□□ 0.85
EDC4-211ENST00000575514 MYO9BQ13459 2157 aa20.32■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 SEMA3FQ13275 785 aa20.32■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 PTK7Q13308 1070 aa20.32■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 NEDD9Q14511 834 aa20.32■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 PCNX4Q63HM2 1172 aa20.32■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 XRRA1Q6P2D8 792 aa20.32■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 CCDC82Q8N4S0 544 aa20.32■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 SLC9A7Q96T83 725 aa20.32■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.32■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.32■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.32■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 DOCK5Q9H7D0 1870 aa20.32■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa20.31■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 NOP56O00567 594 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 BAIAP3O94812 1187 aa20.31■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 PARNO95453 639 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 CKBP12277 381 aa20.31■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 MYOGP15173 224 aa20.31■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 PPP2R2DQ66LE6 453 aa20.31■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 METTL7BQ6UX53 244 aa20.31■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.31■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 CYFIP1Q7L576 1253 aa20.31■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 LGALS2P05162 132 aa20.3■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 HIC1Q14526 733 aa20.3■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 GPNMBQ14956 572 aa20.3■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 TSGA10IPQ3SY00 556 aa20.3■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 APOA5Q6Q788 366 aa20.3■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 RASEFQ8IZ41 740 aa20.3■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa20.3■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 H3BRB1 525 aa20.29■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 ADCK5Q3MIX3 580 aa20.29■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa20.29■□□□□ 0.84
EDC4-211ENST00000575514 NLRX1Q86UT6 975 aa20.29■□□□□ 0.84
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