RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	29.25	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	29.25	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	CAGE1	Q8TC20	777 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	IGFBP4	P22692	258 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	SESTD1	Q86VW0	696 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	29.24	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	GBF1	Q92538	1859 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	29.24	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	VWCE	Q96DN2	955 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	PPFIA4	O75335	1185 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	CALM1	P0DP23	149 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	CALM2	P0DP24	149 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	CALM3	P0DP25	149 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	TGFB3	P10600	412 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	MYOG	P15173	224 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	SP2	Q02086	613 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	RNF20	Q5VTR2	975 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	F2	P00734	622 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	SELP	P16109	830 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	NECTIN1	Q15223	517 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	29.21	■■■□□ 2.27
PPP4C-208	ENST00000564966	SMARCA1	P28370	1054 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	LIFR	P42702	1097 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	KCNJ6	P48051	423 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	MICU3	Q86XE3	530 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC9A7	Q96T83	725 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	STAM2	O75886	525 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	29.19	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	29.19	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	29.19	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	29.19	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	HAS3	O00219	553 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	CKB	P12277	381 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	SP4	Q02446	784 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	PTK7	Q13308	1070 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	NEDD9	Q14511	834 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	USP38	Q8NB14	1042 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	EYS	Q5T1H1	3165 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	KIF28P	B7ZC32	967 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	FIBP	O43427	364 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	FANCB	Q8NB91	859 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	MYO9B	Q13459	2157 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	BAIAP3	O94812	1187 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	CA3	P07451	260 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	29.16	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	NLRX1	Q86UT6	975 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	29.16	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	NEK1	Q96PY6	1258 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966		H3BRB1	525 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	29.15	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	LGALS2	P05162	132 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	METTL7B	Q6UX53	244 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	29.15	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	CERS4	Q9HA82	394 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	PIK3CD	O00329	1044 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	MEIS2	O14770	477 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	CDC45	O75419	566 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	ICAM3	P32942	547 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	ADGRE1	Q14246	886 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	29.14	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP4C-208	ENST00000564966	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		29.14	■■■□□ 2.26

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