RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552440.5

USP44-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 44, human

TSL 5 BASIC

Gene USP44, Length 1,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP44-208	ENST00000552440	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		5.08	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		5.08	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		5.08	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	GMIP	Q9P107	970 aa		5.08	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		5.08	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		5.08	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	DNAJA2	O60884	412 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	MED14OS	P0DP75	135 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	BIRC3	Q13489	604 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	KRT72	Q14CN4	511 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	NKG7	Q16617	165 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	USP33	Q8TEY7	942 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	GJA10	Q969M2	543 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	ATG4C	Q96DT6	458 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	SERINC2	Q96SA4	455 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	DIRC2	Q96SL1	478 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	CSRNP2	Q9H175	543 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	ABCC9	O60706	1549 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440		A0A1W2PRQ8	180 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	SUSD5	O60279	629 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	HPX	P02790	462 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	C1QTNF9	P0C862	333 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	TNK2	Q07912	1038 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	KCNN1	Q92952	543 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	TMEM87B	Q96K49	555 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	SLC9A7	Q96T83	725 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	EPN3	Q9H201	632 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	APAF1	O14727	1248 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	TNFRSF10C	O14798	259 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	GPR39	O43194	453 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	ORC4	O43929	436 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	RENBP	P51606	427 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	STK3	Q13188	491 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	MLEC	Q14165	292 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	SNX17	Q15036	470 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	KCNA10	Q16322	511 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	CFAP161	Q6P656	301 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	LILRA6	Q6PI73	481 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	CDH24	Q86UP0	819 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	CREG2	Q8IUH2	290 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	KIF2C	Q99661	725 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	FITM1	A5D6W6	292 aa		5.05	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	TTC36	A6NLP5	189 aa		5.05	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		5.05	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	GABRD	O14764	452 aa		5.05	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	RHOBTB3	O94955	611 aa		5.05	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	TGFB3	P10600	412 aa		5.05	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	CHRNE	Q04844	493 aa		5.05	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	STRN3	Q13033	797 aa		5.05	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
USP44-208	ENST00000552440	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		5.05	□□□□□ -1.6

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