RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 USP6NLQ92738 828 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 RIT2Q99578 217 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 SENP7Q9BQF6 1050 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 WDR11Q9BZH6 1224 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 WBP1LQ9NX94 342 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 CNPY2Q9Y2B0 182 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 CLIC4Q9Y696 253 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 A0A1W2PQ27 194 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 A0A1W2PQ64 194 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 A0A1W2PQD8 194 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 FAM205CA6NFA0 338 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 PEX10O60683 326 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 TXLNAP40222 546 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 NEDD9Q14511 834 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 FAM173BQ6P4H8 233 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 ERMNQ8TAM6 284 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 SCFD2Q8WU76 684 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 CCDC34Q96HJ3 373 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 MAML3Q96JK9 1138 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 PGBD1Q96JS3 809 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 MTMR9Q96QG7 549 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 TINF2Q9BSI4 451 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 KCNMB3Q9NPA1 279 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 GJD2Q9UKL4 321 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 PCDHA12Q9UN75 941 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-220ENST00000550700 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 FAM86B1E9PN63 330 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 ADAMTS3O15072 1205 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 COBLO75128 1261 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 TDP2O95551 362 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 FAM86B2P0C5J1 330 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 ITGB5P18084 799 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 UBE2HP62256 183 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 TTLL4Q14679 1199 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 MFSD14CQ5VZR4 134 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 ARMCX2Q7L311 632 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 C4orf32Q8N8J7 132 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 RDM1Q8NG50 284 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 PXYLP1Q8TE99 480 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 SLC5A5Q92911 643 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 TRIM47Q96LD4 638 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 SDF4Q9BRK5 362 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 ZNF577Q9BSK1 485 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 KCNH7Q9NS40 1196 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 FAM13BQ9NYF5 915 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 SRRDQ9UH36 339 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 NFASCO94856 1347 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 LRRC37A2A6NM11 1700 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP10.51□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 GAS7O60861 476 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 MBD3O95983 291 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 MUTP22033 750 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 CMA1P23946 247 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 SFNP31947 248 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 MCM4P33991 863 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 KRT76Q01546 638 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 LRCH2Q5VUJ6 765 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 HAUS3Q68CZ6 603 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 IQSEC1Q6DN90 963 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 ETNPPLQ8TBG4 499 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 NEK9Q8TD19 979 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 LENG9Q96B70 501 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 TEKT3Q9BXF9 490 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 LRWD1Q9UFC0 647 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 CCDC39Q9UFE4 941 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 MRVI1Q9Y6F6 885 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 MCM3APO60318 1980 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 MSH4O15457 936 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 SLC37A4O43826 429 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 PRR29P0C7W0 189 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 CYP2B6P20813 491 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 UBA7P41226 1012 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 TXKP42681 527 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 FLT3LGP49771 235 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 JAK3P52333 1124 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 UBXN2AP68543 259 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 PPP2R5CQ13362 524 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 KRT79Q5XKE5 535 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms