RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-206ENST00000534219 TCEANC2Q96MN5 208 aa28.75■■■□□ 2.19
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PTPRJ-206ENST00000534219 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
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PTPRJ-206ENST00000534219 PCDHA6Q9UN73 950 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRJ-206ENST00000534219 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRJ-206ENST00000534219 V9GY48 417 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
PTPRJ-206ENST00000534219 NAPAP54920 295 aa28.63■■■□□ 2.17
PTPRJ-206ENST00000534219 WWC2Q6AWC2 1192 aa28.63■■■□□ 2.17
PTPRJ-206ENST00000534219 GPR20Q99678 358 aa28.63■■■□□ 2.17
PTPRJ-206ENST00000534219 SENP7Q9BQF6 1050 aa28.63■■■□□ 2.17
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