RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533628.5

RPUSD4-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD4, Length 2,053 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4-208ENST00000533628 MSCO60682 206 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 CYP3A7P24462 503 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 CEP55Q53EZ4 464 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 NIPA1Q7RTP0 329 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 LENG9Q96B70 501 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 GPRASP2Q96D09 838 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 CTAGE5O15320 804 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 FIBPO43427 364 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 SGPL1O95470 568 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 TGFB3P10600 412 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 PDCP20941 246 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 GJA8P48165 433 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 BECN1Q14457 450 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 TTLL4Q14679 1199 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 COPS5Q92905 334 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 OGDHLQ9ULD0 1010 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 Q9Y3F1 56 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 WNT7AO00755 349 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 ADAMTS4O75173 837 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 ARP10275 920 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 TXNP10599 105 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 LY6KQ17RY6 165 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 GNPTABQ3T906 1256 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 KCNV1Q6PIU1 500 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 MOXD1Q6UVY6 613 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 NEK8Q86SG6 692 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 NLRX1Q86UT6 975 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 NOSTRINQ8IVI9 506 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.47□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 H3BQV1 296 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 MAFGO15525 162 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 ATP9AO75110 1047 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 TDP2O95551 362 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 RARBP10826 455 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 GJA9P57773 515 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 IFFO2Q5TF58 517 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 KCNH7Q9NS40 1196 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 MTMR6Q9Y217 621 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 KCNA2P16389 499 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 ARHGAP1Q07960 439 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 MTMR1Q13613 665 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 Q4G0T1 1027 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 PPP4R3AQ6IN85 833 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 KLHDC9Q8NEP7 349 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 SENP7Q9BQF6 1050 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
RPUSD4-208ENST00000533628 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa14.46□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 ZNF76P36508 570 aa14.45□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 PLA2G4DQ86XP0 818 aa14.45□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa14.45□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 MYADML2A6NDP7 307 aa14.45□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 STX6O43752 255 aa14.45□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 PGK1P00558 417 aa14.45□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 LETM2Q2VYF4 491 aa14.45□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 TLK2Q86UE8 772 aa14.45□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 CDHR1Q96JP9 859 aa14.45□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 BRCA2P51587 3418 aa14.44□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 DHX15O43143 795 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 SLC37A4O43826 429 aa14.44□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 GH1P01241 217 aa14.44□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 CAPN2P17655 700 aa14.44□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 CST5P28325 142 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 RESTQ13127 1097 aa14.44□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 LRRC41Q15345 812 aa14.44□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 PRR16Q569H4 304 aa14.44□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 MYSM1Q5VVJ2 828 aa14.44□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 MCTP1Q6DN14 999 aa14.44□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 MSH4O15457 936 aa14.43□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 GGPS1O95749 300 aa14.43□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 CLCN1P35523 988 aa14.43□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 SETQ01105 290 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 TELO2Q9Y4R8 837 aa14.43□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 DOCK5Q9H7D0 1870 aa14.43□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.43□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 TRAPPC10P48553 1259 aa14.43□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 LAMC2Q13753 1193 aa14.43□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 NEDD9Q14511 834 aa14.43□□□□□ -0.1
RPUSD4-208ENST00000533628 OR6J1Q8NGC5 347 aa14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms