RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527137.2

GNPTG-204, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, human

TSL 2 BASIC

Gene GNPTG, Length 386 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNPTG-204	ENST00000527137	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	28.28	■■■□□ 2.12
GNPTG-204	ENST00000527137	MEIS1	O00470	390 aa		28.28	■■■□□ 2.12
GNPTG-204	ENST00000527137	ADCY6	O43306	1168 aa		28.28	■■■□□ 2.12
GNPTG-204	ENST00000527137	FIBP	O43427	364 aa		28.28	■■■□□ 2.12
GNPTG-204	ENST00000527137	ARIH2	O95376	493 aa		28.28	■■■□□ 2.12
GNPTG-204	ENST00000527137	AR	P10275	920 aa		28.28	■■■□□ 2.12
GNPTG-204	ENST00000527137	CYP3A7	P24462	503 aa		28.28	■■■□□ 2.12
GNPTG-204	ENST00000527137	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	28.28	■■■□□ 2.12
GNPTG-204	ENST00000527137	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		28.28	■■■□□ 2.12
GNPTG-204	ENST00000527137	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		28.28	■■■□□ 2.12
GNPTG-204	ENST00000527137	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		28.28	■■■□□ 2.12
GNPTG-204	ENST00000527137	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	28.28	■■■□□ 2.12
GNPTG-204	ENST00000527137	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	28.28	■■■□□ 2.12
GNPTG-204	ENST00000527137	WDR81	Q562E7	1941 aa		28.28	■■■□□ 2.12
GNPTG-204	ENST00000527137	PTGS1	P23219	599 aa		28.27	■■■□□ 2.12
GNPTG-204	ENST00000527137	ICAM3	P32942	547 aa		28.27	■■■□□ 2.12
GNPTG-204	ENST00000527137	MCM7	P33993	719 aa		28.27	■■■□□ 2.12
GNPTG-204	ENST00000527137	TTLL4	Q14679	1199 aa		28.27	■■■□□ 2.12
GNPTG-204	ENST00000527137	ZNF174	Q15697	407 aa		28.27	■■■□□ 2.12
GNPTG-204	ENST00000527137	POTED	Q86YR6	584 aa		28.27	■■■□□ 2.12
GNPTG-204	ENST00000527137	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		28.27	■■■□□ 2.12
GNPTG-204	ENST00000527137	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		28.27	■■■□□ 2.12
GNPTG-204	ENST00000527137	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	28.27	■■■□□ 2.12
GNPTG-204	ENST00000527137	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		28.27	■■■□□ 2.12
GNPTG-204	ENST00000527137	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		28.26	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	AKR1A1	P14550	325 aa		28.26	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	NUCB2	P80303	420 aa		28.26	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	MTFR1	Q15390	333 aa		28.26	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	28.26	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137		Q4G0T1	1027 aa		28.26	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	28.26	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	ANO1	Q5XXA6	986 aa		28.26	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		28.26	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	28.26	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	ARMC5	Q96C12	935 aa		28.26	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	28.26	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		28.26	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	SEPT4	O43236	478 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	SORBS3	O60504	671 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	28.25	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	SMPD1	P17405	629 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	28.25	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	TNFAIP2	Q03169	654 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	LY6K	Q17RY6	165 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	COPS5	Q92905	334 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	ZNF333	Q96JL9	665 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	CDHR1	Q96JP9	859 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	28.25	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	28.25	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	NEMF	O60524	1076 aa		28.24	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	28.24	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	28.24	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	MSH4	O15457	936 aa		28.23	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	ATP9A	O75110	1047 aa		28.23	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	CCL5	P13501	91 aa		28.23	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	SP2	Q02086	613 aa		28.23	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		28.23	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	GJA10	Q969M2	543 aa		28.23	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	28.23	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	KCNA2	P16389	499 aa		28.22	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		28.22	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		28.22	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		28.22	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		28.22	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	28.22	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	GGPS1	O95749	300 aa		28.21	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	TGFB3	P10600	412 aa		28.21	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	28.21	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	28.21	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		28.21	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		28.21	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		28.21	■■■□□ 2.11
GNPTG-204	ENST00000527137	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	28.2	■■■□□ 2.1
GNPTG-204	ENST00000527137	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	28.2	■■■□□ 2.1
GNPTG-204	ENST00000527137	MAFG	O15525	162 aa		28.2	■■■□□ 2.1
GNPTG-204	ENST00000527137	CALCRL	Q16602	461 aa		28.2	■■■□□ 2.1
GNPTG-204	ENST00000527137	TLK2	Q86UE8	772 aa		28.2	■■■□□ 2.1
GNPTG-204	ENST00000527137	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		28.2	■■■□□ 2.1
GNPTG-204	ENST00000527137	USP28	Q96RU2	1077 aa		28.2	■■■□□ 2.1
GNPTG-204	ENST00000527137	RNF208	Q9H0X6	261 aa		28.2	■■■□□ 2.1
GNPTG-204	ENST00000527137	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	28.2	■■■□□ 2.1
GNPTG-204	ENST00000527137	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	28.19	■■■□□ 2.1
GNPTG-204	ENST00000527137	GH1	P01241	217 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GNPTG-204	ENST00000527137	RARB	P10826	455 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GNPTG-204	ENST00000527137	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	28.19	■■■□□ 2.1
GNPTG-204	ENST00000527137	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	28.19	■■■□□ 2.1
GNPTG-204	ENST00000527137	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GNPTG-204	ENST00000527137	SLC5A5	Q92911	643 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GNPTG-204	ENST00000527137	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	28.19	■■■□□ 2.1
GNPTG-204	ENST00000527137	CLIC4	Q9Y696	253 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GNPTG-204	ENST00000527137	HTT	P42858	3142 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GNPTG-204	ENST00000527137	MARCH6	O60337	910 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GNPTG-204	ENST00000527137	OR52Z1	P0C646	297 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GNPTG-204	ENST00000527137	ARHGAP1	Q07960	439 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GNPTG-204	ENST00000527137	PTGDR	Q13258	359 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GNPTG-204	ENST00000527137	NEDD9	Q14511	834 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GNPTG-204	ENST00000527137	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
GNPTG-204	ENST00000527137	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1

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