RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 CCND2P30279 289 aa19.6■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 ANTXR2P58335 489 aa19.6■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 HSDL1Q3SXM5 330 aa19.6■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 CATIPQ7Z7H3 387 aa19.6■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa19.6■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 PIBF1Q8WXW3 757 aa19.6■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 MAP4K1Q92918 833 aa19.6■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 CERS4Q9HA82 394 aa19.6■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 TET1Q8NFU7 2136 aa19.6■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 KIF28PB7ZC32 967 aa19.59■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 RBL2Q08999 1139 aa19.59■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 MICALL1Q8N3F8 863 aa19.59■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP19.59■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 MYH7BA7E2Y1 1941 aa19.59■□□□□ 0.73
HERC3-211ENST00000513325 NBNO60934 754 aa19.58■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 ARHGEF15O94989 841 aa19.58■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 TGFB3P10600 412 aa19.58■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 KCNJ6P48051 423 aa19.58■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 TAP1Q03518 808 aa19.58■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 PTK7Q13308 1070 aa19.58■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 ASB2Q96Q27 587 aa19.58■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 MLXIPQ9HAP2 919 aa19.58■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa19.57■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 PARNO95453 639 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 WDR5P61964 334 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 HIC1Q14526 733 aa19.57■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 WNT8BQ93098 351 aa19.57■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 C16orf70Q9BSU1 422 aa19.57■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 BCAS3Q9H6U6 928 aa19.57■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 CHD7Q9P2D1 2997 aa19.57■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 EPOPA6NHQ4 379 aa19.56■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 TLL1O43897 1013 aa19.56■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 CXCL10P02778 98 aa19.56■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 TCTN1Q2MV58 587 aa19.56■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 ZNF618Q5T7W0 954 aa19.56■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 CNKSR3Q6P9H4 555 aa19.56■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 TRAF7Q6Q0C0 670 aa19.56■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 ZNF654Q8IZM8 581 aa19.56■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 ARNTL2Q8WYA1 636 aa19.56■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 MYL10Q9BUA6 226 aa19.56■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 LY9Q9HBG7 655 aa19.56■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 DEFB103AP81534 67 aa19.55■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 RTEL1Q9NZ71 1219 aa19.55■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 MTCH2Q9Y6C9 303 aa19.55■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 FRMPD4Q14CM0 1322 aa19.54■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa19.54■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 LCHNA4D1U4 455 aa19.54■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 DDAH1O94760 285 aa19.54■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 MBTPS1Q14703 1052 aa19.54■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 GNPTABQ3T906 1256 aa19.54■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 SPRED2Q7Z698 418 aa19.54■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 MAP3K14Q99558 947 aa19.54■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 ZBED2Q9BTP6 218 aa19.54■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 SPZ1Q9BXG8 430 aa19.54■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 PTPRSQ13332 1948 aa19.53■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa19.53■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 H3BRB1 525 aa19.53■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 TNFRSF10AO00220 468 aa19.53■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 NOP56O00567 594 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 PRC1O43663 620 aa19.53■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 STAM2O75886 525 aa19.53■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 LGALS2P05162 132 aa19.53■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 ICAM3P32942 547 aa19.53■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 KIF5BP33176 963 aa19.53■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 KRT40Q6A162 431 aa19.53■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 USP17L6PQ6QN14 398 aa19.53■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 CASC1Q6TDU7 716 aa19.53■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 SERINC5Q86VE9 423 aa19.53■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa19.53■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 C17orf102A2RUQ5 167 aa19.52■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 SMARCA1P28370 1054 aa19.52■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 THPOP40225 353 aa19.52■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 SEMA3FQ13275 785 aa19.52■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 IKBKEQ14164 716 aa19.52■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 NEDD9Q14511 834 aa19.52■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 NFXL1Q6ZNB6 911 aa19.52■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 CYFIP1Q7L576 1253 aa19.52■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa19.52■□□□□ 0.72
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