RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 KIAA0753Q2KHM9 967 aa26.16■■□□□ 1.78
TRDMT1-211ENST00000495022 MYSM1Q5VVJ2 828 aa26.16■■□□□ 1.78
TRDMT1-211ENST00000495022 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
TRDMT1-211ENST00000495022 PIGSQ96S52 555 aa26.16■■□□□ 1.78
TRDMT1-211ENST00000495022 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
TRDMT1-211ENST00000495022 PPFIA4O75335 1185 aa26.15■■□□□ 1.78
TRDMT1-211ENST00000495022 CXCL10P02778 98 aa26.15■■□□□ 1.78
TRDMT1-211ENST00000495022 POLR2MP0CAP2 368 aa26.15■■□□□ 1.78
TRDMT1-211ENST00000495022 CKBP12277 381 aa26.15■■□□□ 1.78
TRDMT1-211ENST00000495022 KCNJ6P48051 423 aa26.15■■□□□ 1.78
TRDMT1-211ENST00000495022 GPNMBQ14956 572 aa26.15■■□□□ 1.78
TRDMT1-211ENST00000495022 WTAPQ15007 396 aa26.15■■□□□ 1.78
TRDMT1-211ENST00000495022 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
TRDMT1-211ENST00000495022 NCOA7Q8NI08 942 aa26.15■■□□□ 1.78
TRDMT1-211ENST00000495022 ALG1Q9BT22 464 aa26.15■■□□□ 1.78
TRDMT1-211ENST00000495022 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa26.14■■□□□ 1.78
TRDMT1-211ENST00000495022 TNFRSF10AO00220 468 aa26.14■■□□□ 1.78
TRDMT1-211ENST00000495022 CCND2P30279 289 aa26.14■■□□□ 1.78
TRDMT1-211ENST00000495022 TROAPQ12815 778 aa26.14■■□□□ 1.78
TRDMT1-211ENST00000495022 PTK7Q13308 1070 aa26.14■■□□□ 1.78
TRDMT1-211ENST00000495022 CNKSR3Q6P9H4 555 aa26.14■■□□□ 1.78
TRDMT1-211ENST00000495022 IL31RAQ8NI17 732 aa26.14■■□□□ 1.78
TRDMT1-211ENST00000495022 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 E7EWF7 191 aa26.13■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 CYTH3O43739 400 aa26.13■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 WDR5P61964 334 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 TAP1Q03518 808 aa26.13■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 SPATA33Q96N06 139 aa26.13■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 SENP2Q9HC62 589 aa26.13■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 SGSM2O43147 1006 aa26.12■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 GGPS1O95749 300 aa26.12■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 HSDL1Q3SXM5 330 aa26.12■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 MICALL1Q8N3F8 863 aa26.12■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 SIP14410 1827 aa26.12■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 TLL1O43897 1013 aa26.11■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 NBNO60934 754 aa26.11■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 CATIPQ7Z7H3 387 aa26.11■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 CERS4Q9HA82 394 aa26.11■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 MTCH2Q9Y6C9 303 aa26.11■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 TAF6LQ9Y6J9 622 aa26.11■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 FRMPD4Q14CM0 1322 aa26.11■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 EPOPA6NHQ4 379 aa26.1■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 EFCAB14O75071 495 aa26.1■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 SP2Q02086 613 aa26.1■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 FCHSD1Q86WN1 690 aa26.1■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 IL27Q8NEV9 243 aa26.1■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa26.1■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa26.09■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 RFXAPO00287 272 aa26.09■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 STAM2O75886 525 aa26.09■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 ARHGEF15O94989 841 aa26.09■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 ARNTL2Q8WYA1 636 aa26.09■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 C16orf70Q9BSU1 422 aa26.09■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 MLXIPQ9HAP2 919 aa26.09■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 GNPTABQ3T906 1256 aa26.08■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 TRAF7Q6Q0C0 670 aa26.08■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa26.08■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 MAP4K1Q92918 833 aa26.08■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 MAP3K14Q99558 947 aa26.08■■□□□ 1.77
TRDMT1-211ENST00000495022 SORBS3O60504 671 aa26.07■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 ANTXR2P58335 489 aa26.07■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 DEFB103AP81534 67 aa26.07■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 AAK1Q2M2I8 961 aa26.07■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF618Q5T7W0 954 aa26.07■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP26.07■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 WNT8BQ93098 351 aa26.07■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 EMSYQ7Z589 1322 aa26.07■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 ICAM3P32942 547 aa26.07■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 IKBKEQ14164 716 aa26.07■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 HIC1Q14526 733 aa26.07■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 SERINC5Q86VE9 423 aa26.07■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 ZBED2Q9BTP6 218 aa26.07■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 SPZ1Q9BXG8 430 aa26.07■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 GJB5O95377 273 aa26.06■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 HOXC8P31273 242 aa26.06■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 MBTPS1Q14703 1052 aa26.06■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 TCTN1Q2MV58 587 aa26.06■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 MTA3Q9BTC8 594 aa26.06■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 H3BRB1 525 aa26.05■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 DDAH1O94760 285 aa26.05■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 SMARCA1P28370 1054 aa26.05■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 KIF5BP33176 963 aa26.05■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 NEDD9Q14511 834 aa26.05■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 RAD9AQ99638 391 aa26.05■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 LY9Q9HBG7 655 aa26.05■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
TRDMT1-211ENST00000495022 C17orf102A2RUQ5 167 aa26.04■■□□□ 1.76
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