RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494420.1

HOXB-AS3-215, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 431 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF286BP0CG31 522 aa22.21■■□□□ 1.15
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 FGD1P98174 961 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BFSP2Q13515 415 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C7orf31Q8N865 590 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GRXCR1A8MXD5 290 aa22.2■■□□□ 1.14
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 RTN1Q16799 776 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DEFB128Q7Z7B8 93 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SESTD1Q86VW0 696 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DNAJB2P25686 324 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ICAM3P32942 547 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM265A0A087WTH1 108 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PITPNM1O00562 1244 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FIBPO43427 364 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 F2P00734 622 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IQCF3P0C7M6 154 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CPA1P15085 419 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NEDD9Q14511 834 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NLRX1Q86UT6 975 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KCNB2Q92953 911 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TIFAQ96CG3 184 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZBBXA8MT70 800 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HAS3O00219 553 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 REC8O95072 547 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PFKMP08237 780 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HSPA4P34932 840 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RFC2P35250 354 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PBX2P40425 430 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 UBE2SQ16763 222 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PBX4Q9BYU1 374 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.16■■□□□ 1.14
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 SEMA3FQ13275 785 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 Q6ZUG5 572 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CAGE1Q8TC20 777 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 VWCEQ96DN2 955 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MSRAQ9UJ68 235 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ACTN1P12814 892 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NAPAP54920 295 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 METTL7BQ6UX53 244 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MYLIPQ8WY64 445 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF576Q9H609 170 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 APOBRQ0VD83 1088 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FUT2Q10981 343 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RAB30Q15771 203 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 USP26Q9BXU7 913 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 H3BRB1 525 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LGALS2P05162 132 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PSMA5P28066 241 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CDC27P30260 824 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RCAN1P53805 252 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SP4Q02446 784 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PTK7Q13308 1070 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GRIN2CQ14957 1233 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BRF1Q92994 677 aa22.13■■□□□ 1.13
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