RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490510.5

PITRM1-211, Transcript of pitrilysin metallopeptidase 1, humanhuman

TSL 2

Gene PITRM1, Length 778 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1-211ENST00000490510 HAS3O00219 553 aa22.14■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 F2P00734 622 aa22.14■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 SMARCA1P28370 1054 aa22.14■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 RFC2P35250 354 aa22.14■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 MFSD10Q14728 455 aa22.14■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.14■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.14■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 SPATA33Q96N06 139 aa22.14■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.14■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.14■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 CCDC69A6NI79 296 aa22.13■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 TGFB3P10600 412 aa22.13■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 LIFRP42702 1097 aa22.13■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.13■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.13■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.13■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.13■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 PPFIA4O75335 1185 aa22.12■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 MYOGP15173 224 aa22.12■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 GNAQP50148 359 aa22.12■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 GPNMBQ14956 572 aa22.12■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 C7orf31Q8N865 590 aa22.12■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 CAGE1Q8TC20 777 aa22.12■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.12■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22.12■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 MEIS2O14770 477 aa22.11■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 SEMA3FQ13275 785 aa22.11■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 USP38Q8NB14 1042 aa22.11■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.11■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.11■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.1■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 ACTN1P12814 892 aa22.1■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 ICAM3P32942 547 aa22.1■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 HIC1Q14526 733 aa22.1■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.1■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.1■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.1■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 GBF1Q92538 1859 aa22.1■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.1■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.1■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.1■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.09■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.09■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 PIK3CDO00329 1044 aa22.09■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 CALM1P0DP23 149 aa22.09■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 CALM2P0DP24 149 aa22.09■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 CALM3P0DP25 149 aa22.09■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 SELPP16109 830 aa22.09■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 RBL2Q08999 1139 aa22.09■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 ADGRE1Q14246 886 aa22.09■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.09■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 CUL5Q93034 780 aa22.09■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 WNT8BQ93098 351 aa22.09■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.09■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.09■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 STAM2O75886 525 aa22.08■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 CKBP12277 381 aa22.08■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 GNPTABQ3T906 1256 aa22.08■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.08■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.08■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 RASEFQ8IZ41 740 aa22.08■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.08■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 FANCBQ8NB91 859 aa22.08■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PITRM1-211ENST00000490510 PTK7Q13308 1070 aa22.07■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 RNF20Q5VTR2 975 aa22.07■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.07■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.07■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 MICU3Q86XE3 530 aa22.07■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.07■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 NEK1Q96PY6 1258 aa22.07■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.07■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 TTC28Q96AY4 2481 aa22.07■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 FIBPO43427 364 aa22.06■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 NBNO60934 754 aa22.06■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 LGALS2P05162 132 aa22.06■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 NEDD9Q14511 834 aa22.06■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.06■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.06■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 METTL7BQ6UX53 244 aa22.06■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 SLC9A7Q96T83 725 aa22.06■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.06■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 CDC45O75419 566 aa22.05■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 CXCL10P02778 98 aa22.05■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 TCTN1Q2MV58 587 aa22.05■■□□□ 1.12
PITRM1-211ENST00000490510 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.05■■□□□ 1.12
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