RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 OSBP2Q969R2 916 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 SPATA25Q9BR10 227 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 JAM3Q9BX67 310 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 USP40Q9NVE5 1235 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 NTMQ9P121 344 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF652Q9Y2D9 606 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 NKX3-2P78367 333 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 RASGRF1Q13972 1273 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 NFIXQ14938 502 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 KIZQ2M2Z5 673 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 LCE4AQ5TA78 99 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 STK32CQ86UX6 486 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 MYOTQ9UBF9 498 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 SH3D21A4FU49 640 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 MSCO60682 206 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 GRK2P25098 689 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 GRK3P35626 688 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 CARFQ8N187 725 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 KCNJ15Q99712 375 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 SYT3Q9BQG1 590 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 ALG1Q9BT22 464 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 GNAT1P11488 350 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 GPR85P60893 370 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 NTRK3Q16288 839 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 EMC4Q5J8M3 183 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 STYK1Q6J9G0 422 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 LBX2Q6XYB7 198 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 IFNL3Q8IZI9 196 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 TTLL6Q8N841 843 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 KYQ8NBH2 561 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 RELTQ969Z4 430 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 ARMC5Q96C12 935 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 C20orf173Q96LM9 149 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 GJA9P57773 515 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 LCE1DQ5T752 114 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 CDIP1Q9H305 208 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 DTLQ9NZJ0 730 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGGTB-210ENST00000485459 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 TADA3O75528 432 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 THBS2P35442 1172 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 ITGA1P56199 1179 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 KDM2BQ8NHM5 1336 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC27A2O14975 620 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 ADCY3O60266 1144 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 SOD2P04179 222 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 COL6A2P12110 1019 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 CR1LQ2VPA4 569 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM209AQ5JX71 171 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 SOGA3Q5TF21 947 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 TEPPQ6URK8 271 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 CLIC6Q96NY7 704 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGGTB-210ENST00000485459 B8ZZF3 427 aa6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms