RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 LAMC2Q13753 1193 aa9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 MFSD10Q14728 455 aa9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 KIAA0753Q2KHM9 967 aa9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 SLC35G1Q2M3R5 365 aa9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 RNF20Q5VTR2 975 aa9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 NFRKBQ6P4R8 1299 aa9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC62Q6P9F0 684 aa9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 MICU3Q86XE3 530 aa9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 HERVK_113Q902F9 699 aa9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 TCEANC2Q96MN5 208 aa9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 RIOX1Q9H6W3 641 aa9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 CERS4Q9HA82 394 aa9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 HDAC6Q9UBN7 1215 aa9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 NCOR1O75376 2440 aa9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 DDAH1O94760 285 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 GNAQP50148 359 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 RAB30Q15771 203 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 GNPTABQ3T906 1256 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 TMTC2Q8N394 836 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 MTMR8Q96EF0 704 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM87BQ96K49 555 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 ZBED2Q9BTP6 218 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 IQCF3P0C7M6 154 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 CALM1P0DP23 149 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 CALM2P0DP24 149 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 CALM3P0DP25 149 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 KCNJ6P48051 423 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 SP2Q02086 613 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 UBE2SQ16763 222 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 FAM117BQ6P1L5 589 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 KCNV1Q6PIU1 500 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 CYFIP1Q7L576 1253 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 VSIG10LQ86VR7 867 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 KAT2BQ92831 832 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 NEK1Q96PY6 1258 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 LZTS2Q9BRK4 669 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 KATNAL1Q9BW62 490 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 PSTPIP2Q9H939 334 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 TANC1Q9C0D5 1861 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 TET1Q8NFU7 2136 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 SPDYE3A6NKU9 549 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 KIF28PB7ZC32 967 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 CDC45O75419 566 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 RGS20O76081 388 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 COL9A1P20849 921 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 THPOP40225 353 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 NECTIN1Q15223 517 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 HSDL1Q3SXM5 330 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 BMP2KLQ5H9B9 411 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 MYSM1Q5VVJ2 828 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 LRRC8DQ7L1W4 858 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 FANCBQ8NB91 859 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 PPTC7Q8NI37 304 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 ATP6V0A1Q93050 837 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 SPZ1Q9BXG8 430 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 MAF1Q9H063 256 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 BCAS3Q9H6U6 928 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM265A0A087WTH1 108 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 GOLGA8AA7E2F4 631 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 GOLGA8BA8MQT2 603 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 H3BRB1 525 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 RFXAPO00287 272 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 PITPNM1O00562 1244 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 ZBTB43O43298 467 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 PPFIA4O75335 1185 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 NEFLP07196 543 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 CA3P07451 260 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 PFKMP08237 780 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 CTSHP09668 335 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 CKBP12277 381 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 SELPP16109 830 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 RFC2P35250 354 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 NAPAP54920 295 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 NEDD9Q14511 834 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 RASIP1Q5U651 963 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 NLRX1Q86UT6 975 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 SAMD3Q8N6K7 520 aa9.28□□□□□ -0.92
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