RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472880.1

COL9A3-210, Transcript of collagen type IX alpha 3 chain, humanhuman

TSL 3

Gene COL9A3, Length 959 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3-210ENST00000472880 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
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COL9A3-210ENST00000472880 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.84■■□□□ 1.25
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COL9A3-210ENST00000472880 SP2Q02086 613 aa22.82■■□□□ 1.24
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COL9A3-210ENST00000472880 MYO9BQ13459 2157 aa22.82■■□□□ 1.24
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COL9A3-210ENST00000472880 TET1Q8NFU7 2136 aa22.81■■□□□ 1.24
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COL9A3-210ENST00000472880 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.8■■□□□ 1.24
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COL9A3-210ENST00000472880 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.79■■□□□ 1.24
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COL9A3-210ENST00000472880 SMARCA1P28370 1054 aa22.78■■□□□ 1.24
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COL9A3-210ENST00000472880 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.78■■□□□ 1.24
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COL9A3-210ENST00000472880 WNT8BQ93098 351 aa22.78■■□□□ 1.24
COL9A3-210ENST00000472880 ASB2Q96Q27 587 aa22.78■■□□□ 1.24
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COL9A3-210ENST00000472880 SLC27A2O14975 620 aa22.77■■□□□ 1.24
COL9A3-210ENST00000472880 EFCAB14O75071 495 aa22.77■■□□□ 1.24
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COL9A3-210ENST00000472880 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.77■■□□□ 1.24
COL9A3-210ENST00000472880 METTL7BQ6UX53 244 aa22.77■■□□□ 1.24
COL9A3-210ENST00000472880 SERINC5Q86VE9 423 aa22.77■■□□□ 1.24
COL9A3-210ENST00000472880 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.77■■□□□ 1.24
COL9A3-210ENST00000472880 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.77■■□□□ 1.24
COL9A3-210ENST00000472880 EMSYQ7Z589 1322 aa22.77■■□□□ 1.24
COL9A3-210ENST00000472880 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.76■■□□□ 1.23
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