RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461448.5

SNHG12-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG12, Length 1,629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-201ENST00000461448 TTLL4Q14679 1199 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 WNT7AO00755 349 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 ARP10275 920 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 AKR1A1P14550 325 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 TNFAIP2Q03169 654 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 MTFR1Q15390 333 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF174Q15697 407 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 CDHR1Q96JP9 859 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 UIMC1Q96RL1 719 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 SEPT4O43236 478 aa22.16■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 ARIH2O95376 493 aa22.16■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 ICAM3P32942 547 aa22.16■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 MCM7P33993 719 aa22.16■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 KRT85P78386 507 aa22.16■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 SEMA3FQ13275 785 aa22.16■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 NBR1Q14596 966 aa22.16■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 LY6KQ17RY6 165 aa22.16■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 Q4G0T1 1027 aa22.16■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.16■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 ANO1Q5XXA6 986 aa22.16■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 ARMC5Q96C12 935 aa22.16■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 MBOAT7Q96N66 472 aa22.16■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 MAFGO15525 162 aa22.15■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 SLC37A4O43826 429 aa22.15■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 TGFB3P10600 412 aa22.15■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 CCL5P13501 91 aa22.15■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 SMPD1P17405 629 aa22.15■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.15■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF333Q96JL9 665 aa22.15■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.15■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 LAD1O00515 517 aa22.14■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 LENG9Q96B70 501 aa22.14■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 RNF208Q9H0X6 261 aa22.14■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.14■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 ADCY6O43306 1168 aa22.13■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 MARCH6O60337 910 aa22.13■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 SORBS3O60504 671 aa22.13■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 NEMFO60524 1076 aa22.13■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 ATP9AO75110 1047 aa22.13■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 SP2Q02086 613 aa22.13■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.13■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 POTEDQ86YR6 584 aa22.13■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 COPS5Q92905 334 aa22.13■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.13■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 MSH4O15457 936 aa22.13■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 PTGS1P23219 599 aa22.13■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.12■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 RARBP10826 455 aa22.12■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 USP28Q96RU2 1077 aa22.12■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 TBX3O15119 743 aa22.11■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 YEATS4O95619 227 aa22.11■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 GGPS1O95749 300 aa22.11■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 GH1P01241 217 aa22.11■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 KCNA2P16389 499 aa22.11■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 NEDD9Q14511 834 aa22.11■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 CALCRLQ16602 461 aa22.11■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.11■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 GJA10Q969M2 543 aa22.11■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.11■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.11■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.11■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SNHG12-201ENST00000461448 MSCO60682 206 aa22.1■■□□□ 1.13
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