RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450875.5

CITED1-208, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, human

TSL 2

Gene CITED1, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CITED1-208	ENST00000450875	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	TMEM260	Q9NX78	707 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	PHF24	Q9UPV7	400 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	STK36	Q9NRP7	1315 aa		9.26	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	BRCA2	P51587	3418 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	SORBS3	O60504	671 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	KPNA6	O60684	536 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	ARIH2	O95376	493 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	LARGE1	O95461	756 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	GGPS1	O95749	300 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	PTGS1	P23219	599 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	MCM2	P49736	904 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	CHMP4BP1	P59074	171 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	MTMR1	Q13613	665 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	NEDD9	Q14511	834 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	GALNT17	Q6IS24	598 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	KIF2C	Q99661	725 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	ELP1	O95163	1332 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		9.25	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	MAFG	O15525	162 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	RGS20	O76081	388 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	CTDNEP1	O95476	244 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	SREBF1	P36956	1147 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	RTP1	P59025	263 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	NKX3-2	P78367	333 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	ARHGAP4	P98171	946 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	DGKD	Q16760	1214 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	BLID	Q8IZY5	108 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	AFG1L	Q8WV93	481 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	GPRASP2	Q96D09	838 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	SPATA33	Q96N06	139 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	AIFM3	Q96NN9	605 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	JADE2	Q9NQC1	790 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		9.24	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		9.23	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875		A6NJR5	290 aa		9.23	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		9.23	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		9.23	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	JAK2	O60674	1132 aa		9.23	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	DTNB	O60941	627 aa		9.23	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	MMP3	P08254	477 aa		9.23	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	ICAM3	P32942	547 aa		9.23	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	FOSB	P53539	338 aa		9.23	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	SP2	Q02086	613 aa		9.23	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	SP4	Q02446	784 aa		9.23	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	ARHGAP1	Q07960	439 aa		9.23	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	ITGA7	Q13683	1181 aa		9.23	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	GSE1	Q14687	1217 aa		9.23	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	TRIM60	Q495X7	471 aa		9.23	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	CEP55	Q53EZ4	464 aa		9.23	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		9.23	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		9.23	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		9.23	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	PPTC7	Q8NI37	304 aa		9.23	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		9.23	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		9.23	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	SDF4	Q9BRK5	362 aa		9.23	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		9.23	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		9.23	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		9.23	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		9.23	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	ARVCF	O00192	962 aa		9.22	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	CTAGE5	O15320	804 aa		9.22	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	PPFIA4	O75335	1185 aa		9.22	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	SYN1	P17600	705 aa		9.22	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	ITGB5	P18084	799 aa		9.22	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	KRT2	P35908	639 aa		9.22	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	PSMC6	P62333	389 aa		9.22	□□□□□ -0.93
CITED1-208	ENST00000450875	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93

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