RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433927.1

ELL3-202, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

TSL 5

Gene ELL3, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-202ENST00000433927 MICALL1Q8N3F8 863 aa23.51■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 SPATA33Q96N06 139 aa23.51■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 HAS3O00219 553 aa23.5■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 GGPS1O95749 300 aa23.5■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 CKBP12277 381 aa23.5■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 TROAPQ12815 778 aa23.5■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 PTK7Q13308 1070 aa23.5■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 FCHSD1Q86WN1 690 aa23.5■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 IL27Q8NEV9 243 aa23.5■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 TNFRSF10AO00220 468 aa23.49■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 SGSM2O43147 1006 aa23.49■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 TLL1O43897 1013 aa23.49■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 SLC35G1Q2M3R5 365 aa23.49■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.49■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.49■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 SENP2Q9HC62 589 aa23.49■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 CYTH3O43739 400 aa23.48■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 CXCL10P02778 98 aa23.48■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 WDR5P61964 334 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 TAP1Q03518 808 aa23.48■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 HSDL1Q3SXM5 330 aa23.48■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 IL31RAQ8NI17 732 aa23.48■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 CERS4Q9HA82 394 aa23.48■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 SORBS3O60504 671 aa23.47■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 GPNMBQ14956 572 aa23.47■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 GNPTABQ3T906 1256 aa23.47■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 ARNTL2Q8WYA1 636 aa23.47■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 MAP4K1Q92918 833 aa23.47■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 ZBED2Q9BTP6 218 aa23.47■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa23.46■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 RFXAPO00287 272 aa23.46■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 NBNO60934 754 aa23.46■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 EFCAB14O75071 495 aa23.46■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 STAM2O75886 525 aa23.46■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 SP2Q02086 613 aa23.46■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa23.46■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 MAP3K14Q99558 947 aa23.46■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 MTCH2Q9Y6C9 303 aa23.46■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 TAF6LQ9Y6J9 622 aa23.46■■□□□ 1.35
ELL3-202ENST00000433927 MUC3AQ02505 3323 aa23.45■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 IKBKEQ14164 716 aa23.45■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 AAK1Q2M2I8 961 aa23.45■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa23.45■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 TRANK1O15050 2925 aa23.45■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 PTPRSQ13332 1948 aa23.44■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 NOP56O00567 594 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 KIF5BP33176 963 aa23.44■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 NEDD9Q14511 834 aa23.44■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 ZNF618Q5T7W0 954 aa23.44■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 CASC1Q6TDU7 716 aa23.44■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 PIBF1Q8WXW3 757 aa23.44■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 C16orf70Q9BSU1 422 aa23.44■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 MTA3Q9BTC8 594 aa23.44■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 FRMPD4Q14CM0 1322 aa23.43■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 EMSYQ7Z589 1322 aa23.43■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 EPOPA6NHQ4 379 aa23.43■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 H3BRB1 525 aa23.43■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 DDAH1O94760 285 aa23.43■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 SMARCA1P28370 1054 aa23.43■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 ICAM3P32942 547 aa23.43■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 ANTXR2P58335 489 aa23.43■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 CUL5Q93034 780 aa23.43■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 SPZ1Q9BXG8 430 aa23.43■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 C17orf102A2RUQ5 167 aa23.42■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 ARHGEF15O94989 841 aa23.42■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 THPOP40225 353 aa23.42■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 DEFB103AP81534 67 aa23.42■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 SERINC5Q86VE9 423 aa23.42■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 ZNF654Q8IZM8 581 aa23.42■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 TMTC2Q8N394 836 aa23.42■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa23.42■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 WNT8BQ93098 351 aa23.42■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 RAD9AQ99638 391 aa23.42■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 LZTS2Q9BRK4 669 aa23.42■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 USP26Q9BXU7 913 aa23.42■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa23.41■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 LGR5O75473 907 aa23.41■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 GJB5O95377 273 aa23.41■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 LGALS2P05162 132 aa23.41■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 GNAQP50148 359 aa23.41■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms