RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPTLC2O15270 562 aa11.61□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 COBLO75128 1261 aa11.61□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TDP2O95551 362 aa11.61□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HOXC6P09630 235 aa11.61□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CYP2B6P20813 491 aa11.61□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PTMSP20962 102 aa11.61□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CYP3A7P24462 503 aa11.61□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRMT2P55345 433 aa11.61□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q4G0T1 1027 aa11.61□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KCNV1Q6PIU1 500 aa11.61□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARMCX2Q7L311 632 aa11.61□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 VSIG10LQ86VR7 867 aa11.61□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IL31RAQ8NI17 732 aa11.61□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FERMT2Q96AC1 680 aa11.61□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MAML3Q96JK9 1138 aa11.61□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa11.61□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MYH7BA7E2Y1 1941 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MGAMO43451 1857 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DDX11L8A8MPP1 907 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TBX3O15119 743 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MAFGO15525 162 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EDNRBP24530 442 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRPHP41219 470 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRKCZQ05513 592 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PTGDRQ13258 359 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC39A14Q15043 492 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MFSD14CQ5VZR4 134 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OLFML2BQ68BL8 750 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DTHD1Q6ZMT9 781 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CLEC17AQ6ZS10 378 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC00301Q8NCQ3 95 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RAET1EQ8TD07 263 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CRYGNQ8WXF5 182 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM20AQ96MK3 541 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SDF4Q9BRK5 362 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TINF2Q9BSI4 451 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF577Q9BSK1 485 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 VTA1Q9NP79 307 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 JADE2Q9NQC1 790 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SRRDQ9UH36 339 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TSKSQ9UJT2 592 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MRVI1Q9Y6F6 885 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ELP1O95163 1332 aa11.6□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM86B1E9PN63 330 aa11.59□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MEIS1O00470 390 aa11.59□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC37A4O43826 429 aa11.59□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GAS7O60861 476 aa11.59□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PPP6R2O75170 966 aa11.59□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM86B2P0C5J1 330 aa11.59□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TXLNAP40222 546 aa11.59□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FLT3LGP49771 235 aa11.59□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa11.59□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SEPT14Q6ZU15 432 aa11.59□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NPLOC4Q8TAT6 608 aa11.59□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MORC4Q8TE76 937 aa11.59□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SCFD2Q8WU76 684 aa11.59□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MBOAT7Q96N66 472 aa11.59□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa11.59□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa11.59□□□□□ -0.55
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TGFB3P10600 412 aa11.58□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ITGB5P18084 799 aa11.58□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TXKP42681 527 aa11.58□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IRF5Q13568 498 aa11.58□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TTLL4Q14679 1199 aa11.58□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LRCH2Q5VUJ6 765 aa11.58□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EEPD1Q7L9B9 569 aa11.58□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RASSF8Q8NHQ8 419 aa11.58□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 USP6NLQ92738 828 aa11.58□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FGD4Q96M96 766 aa11.58□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TEKT3Q9BXF9 490 aa11.58□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 WDR11Q9BZH6 1224 aa11.58□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GDPD2Q9HCC8 539 aa11.58□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KCNH7Q9NS40 1196 aa11.58□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TBC1D22BQ9NU19 505 aa11.58□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NRBP1Q9UHY1 535 aa11.58□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RCOR1Q9UKL0 485 aa11.58□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GJD2Q9UKL4 321 aa11.58□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRIM17Q9Y577 477 aa11.58□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 STK24Q9Y6E0 443 aa11.58□□□□□ -0.56
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LCTP09848 1927 aa11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms